124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0540 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  100 
 
 		 673 aa  1397    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  50.76 
 
 		 647 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  32.71 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  29.67 
 
 		 644 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  29.37 
 
 		 642 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  29.41 
 
 		 604 aa  254  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  27.92 
 
 		 627 aa  239  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  28.83 
 
 		 621 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  29.05 
 
 		 621 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  28.44 
 
 		 621 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  28.98 
 
 		 621 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  27.22 
 
 		 650 aa  219  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  26.01 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  26.25 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.62 
 
 		 611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  25.11 
 
 		 670 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 		 663 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.23 
 
 		 569 aa  183  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  25.87 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  25.64 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  25.85 
 
 		 615 aa  158  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  22.4 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  24.68 
 
 		 649 aa  153  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 1505 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  26 
 
 		 610 aa  96.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  25.8 
 
 		 734 aa  94  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  25.06 
 
 		 870 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  23.43 
 
 		 683 aa  83.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  25.85 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.07 
 
 		 602 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 1592 aa  79  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.48 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.94 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  22.19 
 
 		 596 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25 
 
 		 803 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  23.44 
 
 		 622 aa  63.9  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  22.14 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.98 
 
 		 802 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  23.47 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.19 
 
 		 814 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  26.01 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  26.01 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  25 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  22.3 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  28.57 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.33 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  26.21 
 
 		 609 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  24.27 
 
 		 402 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  26.21 
 
 		 609 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  24.94 
 
 		 609 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  26.21 
 
 		 609 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  25.6 
 
 		 604 aa  56.6  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  25.83 
 
 		 608 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  23.83 
 
 		 617 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  25.12 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  23.93 
 
 		 407 aa  55.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.53 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  21.85 
 
 		 625 aa  55.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  23.22 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  21.53 
 
 		 592 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  24.18 
 
 		 627 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.54 
 
 		 801 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.33 
 
 		 777 aa  54.3  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  24.88 
 
 		 609 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  25.45 
 
 		 600 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.99 
 
 		 798 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  23.5 
 
 		 632 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  23.02 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 629 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  24.93 
 
 		 620 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  23.89 
 
 		 602 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  21.44 
 
 		 621 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 623 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  24.25 
 
 		 609 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  20.93 
 
 		 656 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  23.43 
 
 		 636 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  24.48 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  25.72 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  25.36 
 
 		 487 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  21.86 
 
 		 593 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  24.23 
 
 		 596 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  26.42 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  23.85 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  24.55 
 
 		 586 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24 
 
 		 800 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 692 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  27.54 
 
 		 472 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  24.58 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.22 
 
 		 761 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  24.35 
 
 		 835 aa  47.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>