29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0734 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  100 
 
 
407 aa  853    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  25.71 
 
 
644 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.3 
 
 
644 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.02 
 
 
604 aa  76.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  23.94 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  23.28 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  23.93 
 
 
663 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  21.67 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.96 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  21.83 
 
 
622 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  20.7 
 
 
668 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  20.6 
 
 
670 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  22.86 
 
 
363 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  23.6 
 
 
621 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  22.66 
 
 
627 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  22.92 
 
 
621 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.9 
 
 
615 aa  59.7  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  22.41 
 
 
615 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  22.26 
 
 
621 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.41 
 
 
621 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.93 
 
 
673 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  20.74 
 
 
602 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  19.48 
 
 
622 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  20.39 
 
 
610 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.63 
 
 
761 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 
649 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.88 
 
 
868 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00850  cytoplasm protein, putative  29.67 
 
 
466 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>