225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0709 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 647 aa  1338    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  44.95 
 
 		 668 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  40.19 
 
 		 663 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  41.53 
 
 		 670 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  39.51 
 
 		 645 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  40.22 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  34.91 
 
 		 622 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  35.51 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  33.75 
 
 		 615 aa  357  2.9999999999999997e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  32.88 
 
 		 649 aa  353  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.73 
 
 		 569 aa  342  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.81 
 
 		 644 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  27.88 
 
 		 644 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  27.86 
 
 		 621 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  26.11 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  26.37 
 
 		 621 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  29.51 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  26.37 
 
 		 621 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.85 
 
 		 604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  26.23 
 
 		 673 aa  201  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  27.25 
 
 		 627 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  27.49 
 
 		 647 aa  193  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.11 
 
 		 611 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  26.33 
 
 		 602 aa  134  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  29.97 
 
 		 584 aa  123  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  27.78 
 
 		 622 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  26.32 
 
 		 610 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  23.42 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  22.38 
 
 		 593 aa  87  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  24.88 
 
 		 595 aa  87  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  22.93 
 
 		 592 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  25.52 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 		 583 aa  84  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  24.59 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  22.51 
 
 		 598 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  25.26 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  21.2 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.12 
 
 		 801 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  23.68 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.2 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  22.17 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  22.95 
 
 		 598 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  21.94 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  24.71 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.07 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  23.14 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  22.78 
 
 		 599 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  23.28 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  23.64 
 
 		 600 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  20.81 
 
 		 594 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  26.98 
 
 		 593 aa  72  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  20.67 
 
 		 870 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  22.95 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  25.88 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  21.4 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  20.38 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  26.32 
 
 		 626 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  19.3 
 
 		 595 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  24.5 
 
 		 589 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.07 
 
 		 761 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.51 
 
 		 1505 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.28 
 
 		 803 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  23.19 
 
 		 632 aa  70.5  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  24.37 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  22.2 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  22.93 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  23.56 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  20.86 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.56 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.66 
 
 		 837 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  23.56 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.86 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  20.7 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  23 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  22.93 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  22.7 
 
 		 606 aa  67  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  23.32 
 
 		 602 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  24.88 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  22.82 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  23.32 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  21.11 
 
 		 593 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  23.99 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  23.31 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  23.93 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  23.24 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  23.21 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  22.63 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  21.74 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  22.72 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  24.94 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.34 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  23.33 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  23.58 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  21.93 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.94 
 
 		 858 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.94 
 
 		 858 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  22.27 
 
 		 624 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>