156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2939 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
642 aa  1335    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  35.99 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  35.73 
 
 
644 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  29.61 
 
 
611 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  29.59 
 
 
673 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  31.7 
 
 
604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  29.67 
 
 
621 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  29.37 
 
 
621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  28.92 
 
 
621 aa  270  7e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  29.11 
 
 
621 aa  262  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  28.55 
 
 
647 aa  257  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  27.91 
 
 
627 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  30.58 
 
 
650 aa  239  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  29.04 
 
 
663 aa  231  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  25.98 
 
 
670 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  29.51 
 
 
647 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  27.72 
 
 
668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.22 
 
 
569 aa  213  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  24.96 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  26.52 
 
 
649 aa  194  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  28.16 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  25.23 
 
 
622 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  24.54 
 
 
615 aa  162  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  26.39 
 
 
610 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.99 
 
 
602 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  24.57 
 
 
363 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  28.5 
 
 
622 aa  114  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.67 
 
 
1505 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  27.51 
 
 
1592 aa  90.9  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  24.44 
 
 
870 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  23.76 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  24.53 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  23.84 
 
 
734 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.56 
 
 
803 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  24.09 
 
 
610 aa  68.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  31.06 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  22.79 
 
 
611 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  35 
 
 
715 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  22.79 
 
 
609 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  34.46 
 
 
683 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  23.04 
 
 
609 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.29 
 
 
802 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  23.79 
 
 
596 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  23.83 
 
 
600 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  22.48 
 
 
578 aa  63.9  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 
609 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 
609 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 
609 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  22.55 
 
 
609 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  23.7 
 
 
602 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  24.28 
 
 
835 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  23.76 
 
 
592 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.98 
 
 
611 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.74 
 
 
761 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  23.61 
 
 
599 aa  60.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  26.6 
 
 
786 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.6 
 
 
786 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  25.12 
 
 
593 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  32.77 
 
 
412 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.09 
 
 
715 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  23.59 
 
 
589 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  23.25 
 
 
727 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 
677 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  23.4 
 
 
597 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 
677 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  25.25 
 
 
472 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  24.82 
 
 
597 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.29 
 
 
592 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 
626 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  23.63 
 
 
665 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  23.7 
 
 
668 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  23.27 
 
 
626 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  23.4 
 
 
677 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  22.32 
 
 
627 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  22.52 
 
 
672 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  23.97 
 
 
598 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  22.2 
 
 
596 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  23.9 
 
 
620 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  24.7 
 
 
597 aa  54.3  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  21.45 
 
 
603 aa  53.9  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  23.24 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  26.51 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  23.14 
 
 
635 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  23.52 
 
 
605 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  22.47 
 
 
623 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  22.39 
 
 
597 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  23.47 
 
 
595 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  23.08 
 
 
599 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  23.53 
 
 
598 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  22.62 
 
 
601 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  21.5 
 
 
596 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  22.22 
 
 
623 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  23.74 
 
 
627 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>