63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0098 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  48.4 
 
 		 786 aa  702    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  100 
 
 		 835 aa  1692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.4 
 
 		 786 aa  702    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.34 
 
 		 761 aa  657    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.26 
 
 		 798 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.03 
 
 		 800 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.8 
 
 		 803 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.55 
 
 		 802 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.79 
 
 		 801 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.08 
 
 		 814 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.23 
 
 		 692 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.23 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.36 
 
 		 715 aa  353  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  30.71 
 
 		 881 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.71 
 
 		 882 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.65 
 
 		 1160 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.62 
 
 		 881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 882 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.2 
 
 		 841 aa  270  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.63 
 
 		 820 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.01 
 
 		 838 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.89 
 
 		 837 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  29.65 
 
 		 847 aa  258  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.91 
 
 		 833 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.28 
 
 		 860 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.03 
 
 		 858 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.03 
 
 		 858 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.03 
 
 		 858 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.91 
 
 		 840 aa  250  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.89 
 
 		 838 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.23 
 
 		 1505 aa  249  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.7 
 
 		 808 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.7 
 
 		 808 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  29.45 
 
 		 1592 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.68 
 
 		 803 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 1132 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.35 
 
 		 821 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.54 
 
 		 817 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.43 
 
 		 777 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.35 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  48.39 
 
 		 180 aa  96.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  48.39 
 
 		 180 aa  96.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.37 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  23.69 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  21.75 
 
 		 670 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  21.63 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  24.25 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  21.33 
 
 		 615 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  22.6 
 
 		 645 aa  55.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  24.28 
 
 		 642 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.66 
 
 		 569 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  22.17 
 
 		 644 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  22.08 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  22.98 
 
 		 668 aa  52.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  20.1 
 
 		 647 aa  51.6  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.16 
 
 		 621 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.22 
 
 		 621 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  24.12 
 
 		 627 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  22.92 
 
 		 649 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  23.16 
 
 		 621 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  24.35 
 
 		 673 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  29.93 
 
 		 650 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  23.76 
 
 		 647 aa  45.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>