32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1858 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  67.68 
 
 		 786 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  67.68 
 
 		 786 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  48.39 
 
 		 835 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.15 
 
 		 761 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.57 
 
 		 800 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  49.15 
 
 		 802 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  49.15 
 
 		 803 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.62 
 
 		 715 aa  62  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.33 
 
 		 798 aa  61.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.98 
 
 		 814 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.41 
 
 		 681 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.41 
 
 		 692 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.29 
 
 		 801 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 		 882 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.78 
 
 		 882 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  32.98 
 
 		 881 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  31.46 
 
 		 881 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  42.86 
 
 		 1592 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  36.49 
 
 		 860 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.43 
 
 		 1505 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.47 
 
 		 841 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.25 
 
 		 838 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.25 
 
 		 838 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.17 
 
 		 837 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31 
 
 		 817 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 858 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.05 
 
 		 840 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 858 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 858 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 430 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>