70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0213 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  100 
 
 		 881 aa  1791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  94.56 
 
 		 882 aa  1661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  94.78 
 
 		 882 aa  1664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  94.89 
 
 		 881 aa  1670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.86 
 
 		 715 aa  399  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.96 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.15 
 
 		 814 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.87 
 
 		 681 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.87 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.05 
 
 		 801 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.29 
 
 		 803 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  35.19 
 
 		 1160 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.23 
 
 		 800 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.42 
 
 		 808 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.42 
 
 		 808 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.12 
 
 		 833 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.16 
 
 		 860 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.97 
 
 		 761 aa  310  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.65 
 
 		 858 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.07 
 
 		 838 aa  307  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.77 
 
 		 837 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.53 
 
 		 858 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.53 
 
 		 858 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  31.01 
 
 		 847 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.03 
 
 		 841 aa  293  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.47 
 
 		 840 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.73 
 
 		 838 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.01 
 
 		 821 aa  291  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.8 
 
 		 820 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.75 
 
 		 777 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.13 
 
 		 817 aa  281  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.56 
 
 		 798 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  30.75 
 
 		 835 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.96 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  30.96 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 803 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.51 
 
 		 1132 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.05 
 
 		 1592 aa  261  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 1505 aa  260  8e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.41 
 
 		 433 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  56.25 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.28 
 
 		 430 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  49.46 
 
 		 722 aa  95.1  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  46.32 
 
 		 679 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  54.22 
 
 		 722 aa  90.1  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  48.96 
 
 		 589 aa  89  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  47.92 
 
 		 738 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 566 aa  80.9  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  44.66 
 
 		 742 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  47.73 
 
 		 627 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  38.24 
 
 		 605 aa  67  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  35.29 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  37.89 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  37.35 
 
 		 612 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  37.25 
 
 		 619 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  33.78 
 
 		 644 aa  55.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.95 
 
 		 623 aa  55.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  30.97 
 
 		 563 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  30.84 
 
 		 741 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  31.46 
 
 		 180 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  31.46 
 
 		 180 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2137  glycoside hydrolase starch-binding  31.68 
 
 		 752 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 		 703 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  24.82 
 
 		 610 aa  47.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  36.14 
 
 		 555 aa  47  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.17 
 
 		 673 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  31.82 
 
 		 249 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 621 aa  44.3  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>