40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2348 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  97.53 
 
 		 858 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  97.53 
 
 		 858 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 430 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  98.27 
 
 		 858 aa  814    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  71.29 
 
 		 847 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  75 
 
 		 837 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  73 
 
 		 838 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  72.25 
 
 		 838 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  64.16 
 
 		 820 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  61.92 
 
 		 841 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  58.67 
 
 		 833 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.06 
 
 		 840 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.28 
 
 		 803 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.78 
 
 		 817 aa  319  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.52 
 
 		 821 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  47.11 
 
 		 860 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.76 
 
 		 808 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.76 
 
 		 808 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.79 
 
 		 777 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 802 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 803 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.58 
 
 		 801 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.86 
 
 		 692 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.86 
 
 		 681 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.14 
 
 		 1160 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.12 
 
 		 715 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.17 
 
 		 814 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 800 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 882 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  29.68 
 
 		 881 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  29.68 
 
 		 882 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.28 
 
 		 881 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.52 
 
 		 761 aa  93.2  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  25.37 
 
 		 835 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.07 
 
 		 798 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.97 
 
 		 1132 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  22.06 
 
 		 786 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.06 
 
 		 786 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 1505 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  22.91 
 
 		 1592 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>