255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7155 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  100 
 
 
1160 aa  2301    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  42.84 
 
 
715 aa  526  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  35.65 
 
 
881 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  35.26 
 
 
881 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  35.26 
 
 
882 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.26 
 
 
882 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.64 
 
 
814 aa  355  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  36.03 
 
 
800 aa  352  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.51 
 
 
801 aa  350  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.9 
 
 
1132 aa  341  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33 
 
 
802 aa  340  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.41 
 
 
692 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.34 
 
 
1505 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.41 
 
 
681 aa  338  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.15 
 
 
803 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.67 
 
 
838 aa  333  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.96 
 
 
837 aa  333  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.62 
 
 
808 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.62 
 
 
808 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.17 
 
 
858 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  33.21 
 
 
1592 aa  322  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.92 
 
 
858 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.92 
 
 
858 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.21 
 
 
838 aa  318  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  33.16 
 
 
847 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.09 
 
 
761 aa  300  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.02 
 
 
833 aa  297  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.24 
 
 
777 aa  294  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.6 
 
 
803 aa  290  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.94 
 
 
817 aa  290  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.69 
 
 
821 aa  288  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.81 
 
 
840 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.23 
 
 
820 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.71 
 
 
860 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.63 
 
 
841 aa  280  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  32.3 
 
 
835 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.73 
 
 
786 aa  250  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  29.73 
 
 
786 aa  250  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.42 
 
 
798 aa  243  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.57 
 
 
433 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.24 
 
 
430 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  36.74 
 
 
1401 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 
1401 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.36 
 
 
458 aa  101  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.61 
 
 
762 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  34.03 
 
 
456 aa  99.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.69 
 
 
455 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
458 aa  99  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.69 
 
 
455 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  35.94 
 
 
455 aa  98.2  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  39.59 
 
 
1199 aa  97.8  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
459 aa  96.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  34.4 
 
 
1307 aa  95.5  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  35.26 
 
 
455 aa  95.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.57 
 
 
6885 aa  95.1  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.91 
 
 
456 aa  95.1  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.68 
 
 
455 aa  94.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.16 
 
 
455 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  35.12 
 
 
1628 aa  94.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.33 
 
 
455 aa  93.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.51 
 
 
455 aa  92  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  44.39 
 
 
648 aa  91.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
455 aa  91.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.51 
 
 
455 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.75 
 
 
2170 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  38.3 
 
 
1887 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
455 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  33.88 
 
 
918 aa  85.5  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.13 
 
 
598 aa  85.1  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  34.1 
 
 
1067 aa  84.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  34.27 
 
 
680 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  54.26 
 
 
743 aa  82.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  37.57 
 
 
445 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  32.91 
 
 
2334 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.72 
 
 
1042 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.09 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.57 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  27.69 
 
 
741 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  37.58 
 
 
1017 aa  74.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  34.39 
 
 
9585 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  36.04 
 
 
1462 aa  72.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  37 
 
 
854 aa  72.4  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.62 
 
 
3802 aa  72.4  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  37.7 
 
 
561 aa  72  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  31.15 
 
 
771 aa  72  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
1137 aa  72  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  31.75 
 
 
803 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.46 
 
 
880 aa  71.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  40.64 
 
 
680 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.31 
 
 
1121 aa  70.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.03 
 
 
2286 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  49.38 
 
 
608 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 
1209 aa  68.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.48 
 
 
655 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  31.87 
 
 
1172 aa  67.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.71 
 
 
1154 aa  67.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  39.09 
 
 
782 aa  67.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  31.39 
 
 
768 aa  67.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.75 
 
 
729 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>