98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3156 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
741 aa  1497    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.25 
 
 
1462 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.95 
 
 
480 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  29.17 
 
 
404 aa  109  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  28.85 
 
 
394 aa  109  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  27.97 
 
 
410 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  28.17 
 
 
410 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  27.63 
 
 
388 aa  105  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.12 
 
 
1628 aa  101  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  25.43 
 
 
444 aa  101  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  26.91 
 
 
409 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  26.63 
 
 
404 aa  94.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.83 
 
 
6885 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.56 
 
 
680 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0508  diaminopimelate decarboxylase dap decarboxylase  32.02 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.89 
 
 
795 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  23.6 
 
 
1042 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  24.66 
 
 
9585 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.69 
 
 
782 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  26.76 
 
 
454 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  27.69 
 
 
1160 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  28.22 
 
 
771 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.73 
 
 
2068 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  24.31 
 
 
1973 aa  65.1  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  33.16 
 
 
918 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  30.16 
 
 
1735 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
1230 aa  62.4  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  23.4 
 
 
779 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  27.42 
 
 
207 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29 
 
 
2170 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  24.04 
 
 
690 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.12 
 
 
1067 aa  60.1  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  26.42 
 
 
2334 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  28.98 
 
 
527 aa  58.5  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  24.58 
 
 
481 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.7 
 
 
649 aa  58.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  26.2 
 
 
465 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  26.2 
 
 
464 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.39 
 
 
3507 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  24.64 
 
 
456 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3451  hypothetical protein  21.97 
 
 
687 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.35 
 
 
3802 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  29.01 
 
 
692 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.91 
 
 
1199 aa  54.7  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  27.31 
 
 
656 aa  53.9  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  28.82 
 
 
836 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.72 
 
 
743 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  23.08 
 
 
903 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  29.94 
 
 
667 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.36 
 
 
2927 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
459 aa  52.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  24.75 
 
 
455 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.26 
 
 
455 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  24.75 
 
 
455 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  29.59 
 
 
1135 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.11 
 
 
455 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27 
 
 
458 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.55 
 
 
725 aa  51.2  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  27.96 
 
 
354 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  27.82 
 
 
2286 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  25.13 
 
 
458 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  23.84 
 
 
803 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  36.07 
 
 
445 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  27.14 
 
 
455 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.93 
 
 
3027 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  25.6 
 
 
455 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  29.1 
 
 
1363 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  31.67 
 
 
1089 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  23.74 
 
 
455 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  23.74 
 
 
455 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.25 
 
 
456 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0840  hypothetical protein  26.79 
 
 
569 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  34.29 
 
 
970 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  23.59 
 
 
455 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  26.15 
 
 
428 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.95 
 
 
1380 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.04 
 
 
1363 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.98 
 
 
648 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.57 
 
 
455 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  27.64 
 
 
1695 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  28.65 
 
 
683 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  24.14 
 
 
1401 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.43 
 
 
1131 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  23.59 
 
 
455 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.71 
 
 
717 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  26.29 
 
 
701 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.23 
 
 
1787 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0232  fibronectin, type III domain-containing protein  32.88 
 
 
257 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  29.84 
 
 
1065 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  33.05 
 
 
997 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.47 
 
 
5743 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.44 
 
 
4433 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  26.04 
 
 
2052 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  30.51 
 
 
1295 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  25.94 
 
 
670 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  29.31 
 
 
1247 aa  44.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  32.67 
 
 
948 aa  44.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2980  hypothetical protein  34.85 
 
 
774 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>