65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2535 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1373    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  40.29 
 
 		 2002 aa  223  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  35.21 
 
 		 333 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  34.82 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.64 
 
 		 480 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  46.2 
 
 		 337 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  45.4 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  43.65 
 
 		 316 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  35.34 
 
 		 841 aa  92.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.62 
 
 		 4433 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  37.99 
 
 		 253 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  41.1 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.53 
 
 		 3507 aa  84  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  36.84 
 
 		 1042 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  31.31 
 
 		 1363 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.08 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.19 
 
 		 1380 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.16 
 
 		 1363 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  32.35 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.64 
 
 		 2068 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.37 
 
 		 527 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  41.11 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  32.12 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  26.58 
 
 		 836 aa  67.4  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  37.3 
 
 		 995 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  25.87 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  29.88 
 
 		 1973 aa  64.7  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.78 
 
 		 1035 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  27.56 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  33.06 
 
 		 179 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  36.89 
 
 		 903 aa  58.9  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  34.08 
 
 		 1462 aa  58.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  31.39 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  38.46 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 		 566 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.32 
 
 		 9585 aa  53.9  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  23.99 
 
 		 861 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  34.78 
 
 		 999 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  32.17 
 
 		 317 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  37.78 
 
 		 2334 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 673 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 590 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  28.19 
 
 		 715 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  27.48 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.27 
 
 		 804 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  30.53 
 
 		 2286 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  30.71 
 
 		 1735 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  31.91 
 
 		 490 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  31.78 
 
 		 587 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.69 
 
 		 6885 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  36.47 
 
 		 186 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  27.5 
 
 		 1199 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.03 
 
 		 14944 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  27.62 
 
 		 1299 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  34.58 
 
 		 187 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  26.83 
 
 		 1299 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  25.94 
 
 		 741 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0774  hypothetical protein  34.02 
 
 		 922 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.891032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 776 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1123 aa  43.9  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  34.94 
 
 		 478 aa  43.9  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  35.71 
 
 		 1303 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>