17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3946 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  28.48 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 		 590 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  32.12 
 
 		 670 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  29.85 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  28.36 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  28.86 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  33.78 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  29.73 
 
 		 514 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  35.21 
 
 		 2002 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  40.3 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 463 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.33 
 
 		 1035 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1736  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 653 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  26.24 
 
 		 746 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.27 
 
 		 1310 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  26.98 
 
 		 571 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>