26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1791 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 
343 aa  699    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  52.69 
 
 
333 aa  345  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  46.81 
 
 
299 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  42.28 
 
 
316 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.3 
 
 
2002 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.82 
 
 
670 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  35.14 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  26.78 
 
 
746 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  37.59 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  37.5 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  33.11 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  24.84 
 
 
1022 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.5 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
590 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  33.78 
 
 
163 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.41 
 
 
1035 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  29.79 
 
 
253 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  29.75 
 
 
165 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  36.84 
 
 
1152 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  24.71 
 
 
317 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  39.18 
 
 
130 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  33.33 
 
 
1123 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.31 
 
 
587 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  28.4 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  37.18 
 
 
181 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>