21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0752 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  50.8 
 
 
190 aa  195  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  49.73 
 
 
190 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  44.86 
 
 
186 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  33.12 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  32.45 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  32.47 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  31.39 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  31.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  25.67 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  31.15 
 
 
253 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  31.5 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  29.56 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  32.29 
 
 
2002 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  28.93 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  33.33 
 
 
670 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32 
 
 
409 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  34 
 
 
337 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  29.63 
 
 
343 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  26.27 
 
 
316 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  30.83 
 
 
299 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>