23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0672 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  44.78 
 
 		 409 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  43.82 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  41.25 
 
 		 514 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  38.59 
 
 		 670 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.91 
 
 		 1035 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  34.03 
 
 		 2002 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  33.54 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  38.1 
 
 		 1310 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  44.59 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  33.88 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  31.79 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  37.01 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  33.88 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  30 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  31.15 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  34.26 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.99 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  30.25 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  45.4  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1022 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  28.99 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  29.01 
 
 		 172 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>