34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2546 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  35.62 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  32.73 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  33.59 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  38.26 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  31.48 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.97 
 
 		 746 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  31.16 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  32.64 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  26.42 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  34.55 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  29.12 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  30.07 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  33.33 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  29.46 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  36.36 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  29.46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  27.88 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 		 590 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1123 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  29.45 
 
 		 514 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  29.2 
 
 		 316 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 		 497 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1152 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  31.58 
 
 		 571 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  30.14 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  33.02 
 
 		 591 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  33.71 
 
 		 587 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1170  hypothetical protein  27.61 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000883403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  37.18 
 
 		 343 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  29.3 
 
 		 1310 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  30.97 
 
 		 333 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>