36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1186 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  36.9 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  36.05 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  32.64 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  33.55 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  31.48 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  31.18 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  32.45 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  34.25 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  32.28 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  30.86 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  35.66 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  30.5 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.68 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  30.43 
 
 		 2002 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  33.06 
 
 		 670 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  30.41 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  31.11 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  29.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  30.82 
 
 		 337 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  32.14 
 
 		 499 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  30.99 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  28.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  28.76 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1123 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  28.37 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  28.57 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  27.39 
 
 		 591 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  27.78 
 
 		 514 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 463 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  25.56 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  24.29 
 
 		 571 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  26.62 
 
 		 587 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  48.84 
 
 		 1152 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>