22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001260 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  96.84 
 
 
190 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  49.73 
 
 
185 aa  193  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  48.66 
 
 
186 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  37.91 
 
 
165 aa  90.9  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  34.62 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  34.72 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  35.65 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  33.6 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  30.54 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  30.07 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.97 
 
 
746 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  31.54 
 
 
337 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  35.42 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  37.08 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  33.33 
 
 
514 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32.99 
 
 
409 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.88 
 
 
670 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  27.1 
 
 
2002 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  28.21 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>