93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2339 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  100 
 
 		 2002 aa  4045    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  27.18 
 
 		 3320 aa  254  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  40.33 
 
 		 670 aa  227  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  37.58 
 
 		 333 aa  211  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  35.83 
 
 		 343 aa  189  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  41.03 
 
 		 331 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.88 
 
 		 2177 aa  163  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  55.56 
 
 		 841 aa  158  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  49.66 
 
 		 845 aa  154  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.43 
 
 		 1323 aa  152  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  32.2 
 
 		 299 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  31.87 
 
 		 316 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 409 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  37.96 
 
 		 337 aa  107  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  38.27 
 
 		 940 aa  100  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1027 aa  98.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  38.55 
 
 		 720 aa  95.9  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  29.97 
 
 		 514 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  38 
 
 		 998 aa  90.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  45 
 
 		 1439 aa  89.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.14 
 
 		 726 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  46.07 
 
 		 777 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  41.22 
 
 		 2178 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  41.75 
 
 		 1141 aa  84.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  35.87 
 
 		 456 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.47 
 
 		 1035 aa  82.8  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  25.65 
 
 		 746 aa  81.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  43.64 
 
 		 549 aa  80.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  43.59 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  34.08 
 
 		 835 aa  80.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  44.79 
 
 		 1496 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.47 
 
 		 2117 aa  76.3  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 864 aa  76.3  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1022 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  45.98 
 
 		 2192 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  34.03 
 
 		 253 aa  75.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  49.02 
 
 		 916 aa  74.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  28.69 
 
 		 5743 aa  73.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  39.29 
 
 		 1096 aa  72.8  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1538 aa  71.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  38.06 
 
 		 1081 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  45.26 
 
 		 827 aa  70.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  34.19 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  40 
 
 		 1537 aa  69.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.21 
 
 		 1095 aa  68.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  38.26 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  36.24 
 
 		 1004 aa  68.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  41.18 
 
 		 499 aa  67  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  29.91 
 
 		 2528 aa  67  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  23.91 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  38.94 
 
 		 1310 aa  66.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 675 aa  65.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  39.66 
 
 		 608 aa  64.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  38.82 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1998  hypothetical protein  28.64 
 
 		 720 aa  61.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  35.62 
 
 		 607 aa  60.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.43 
 
 		 179 aa  60.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.77 
 
 		 1736 aa  58.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.39 
 
 		 590 aa  57  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  43.66 
 
 		 4357 aa  57  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 463 aa  55.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  42.05 
 
 		 1263 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  31.21 
 
 		 2690 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  41.07 
 
 		 130 aa  54.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  29.41 
 
 		 857 aa  54.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.63 
 
 		 1091 aa  53.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  28.4 
 
 		 163 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1076 aa  53.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  36.62 
 
 		 172 aa  53.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  37.36 
 
 		 772 aa  52.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1213 aa  52.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1193 aa  52  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  42.17 
 
 		 534 aa  52  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  33.33 
 
 		 1303 aa  51.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.96 
 
 		 1073 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  24.36 
 
 		 1313 aa  50.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 2082 aa  50.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.91 
 
 		 2239 aa  50.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  34.62 
 
 		 708 aa  50.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  33.73 
 
 		 699 aa  49.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  21.27 
 
 		 631 aa  49.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  42.53 
 
 		 839 aa  48.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  32.29 
 
 		 185 aa  49.3  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 756 aa  47.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  37.38 
 
 		 176 aa  48.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.69 
 
 		 1212 aa  47.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.59 
 
 		 826 aa  47  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  42.05 
 
 		 897 aa  47  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 893 aa  47  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  31.79 
 
 		 1613 aa  45.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 972 aa  45.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 897 aa  45.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>