36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0673 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  64.2 
 
 		 550 aa  646    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  100 
 
 		 857 aa  1742    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  71.73 
 
 		 486 aa  707    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  32.39 
 
 		 1085 aa  190  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  32.99 
 
 		 1799 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  35.68 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  31.77 
 
 		 568 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  33.24 
 
 		 1262 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  35.21 
 
 		 958 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.36 
 
 		 916 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  39.34 
 
 		 1091 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  31.45 
 
 		 587 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  29.33 
 
 		 869 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  29.3 
 
 		 609 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  26.44 
 
 		 684 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1010  APHP domain protein  46.92 
 
 		 300 aa  101  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  35 
 
 		 797 aa  96.3  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1200 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1213 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  30.67 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.81 
 
 		 1448 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1915  hypothetical protein  27.59 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  30.66 
 
 		 2528 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.6 
 
 		 6885 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  30.56 
 
 		 926 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  29.41 
 
 		 2002 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  59.62 
 
 		 119 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  31.41 
 
 		 545 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 1454 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  33.93 
 
 		 298 aa  48.5  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  29.38 
 
 		 631 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.84 
 
 		 1265 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  31.67 
 
 		 405 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  25.98 
 
 		 2030 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  28.74 
 
 		 1378 aa  45.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  25.19 
 
 		 1619 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>