158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  46.2 
 
 		 1200 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 1213 aa  2436    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.91 
 
 		 1448 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.63 
 
 		 1091 aa  367  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1410 aa  288  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.64 
 
 		 795 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.51 
 
 		 1212 aa  254  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 1000 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  32.59 
 
 		 1085 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.31 
 
 		 584 aa  230  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.89 
 
 		 823 aa  222  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.07 
 
 		 1418 aa  217  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  31.48 
 
 		 675 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  32.14 
 
 		 671 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.29 
 
 		 1109 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.95 
 
 		 933 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  25.41 
 
 		 981 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  54.41 
 
 		 510 aa  145  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.34 
 
 		 1001 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  33.09 
 
 		 857 aa  92  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.53 
 
 		 685 aa  90.9  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.14 
 
 		 208 aa  88.2  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  29.52 
 
 		 926 aa  84  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  30.57 
 
 		 631 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  40.31 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  46.34 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.48 
 
 		 729 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  32.6 
 
 		 2528 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.89 
 
 		 1154 aa  68.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  51.19 
 
 		 561 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  44.57 
 
 		 2334 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.73 
 
 		 743 aa  67.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 608 aa  65.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 2170 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  30.85 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.69 
 
 		 962 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  43.16 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.35 
 
 		 6885 aa  62  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  44.57 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  40.71 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.2 
 
 		 1454 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.06 
 
 		 847 aa  61.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 973 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.41 
 
 		 1158 aa  60.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  48.98 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.62 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2086  hypothetical protein  34.55 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  47.67 
 
 		 1121 aa  58.5  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.4 
 
 		 2122 aa  58.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  41.38 
 
 		 455 aa  57.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  41.38 
 
 		 455 aa  57.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.86 
 
 		 667 aa  58.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  36.36 
 
 		 674 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  36.36 
 
 		 674 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  36.36 
 
 		 674 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  31.85 
 
 		 637 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  40.51 
 
 		 674 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  36.36 
 
 		 674 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  31.79 
 
 		 433 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  36.36 
 
 		 674 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  45.98 
 
 		 543 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  29.32 
 
 		 1378 aa  56.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  40.23 
 
 		 552 aa  56.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  40.23 
 
 		 455 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 		 658 aa  55.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  40.23 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  37.84 
 
 		 617 aa  55.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  37.93 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  40.23 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50.59 
 
 		 460 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.18 
 
 		 674 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.35 
 
 		 674 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  39.24 
 
 		 674 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  28.71 
 
 		 749 aa  55.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  39.08 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  45.98 
 
 		 1137 aa  54.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  39.08 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45.35 
 
 		 1209 aa  53.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  39.64 
 
 		 978 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.79 
 
 		 655 aa  54.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.78 
 
 		 854 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  40.23 
 
 		 787 aa  54.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  37.93 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.02 
 
 		 681 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  33.61 
 
 		 660 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.34 
 
 		 674 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.35 
 
 		 2000 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 		 1321 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  27.18 
 
 		 2002 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.44 
 
 		 372 aa  52.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  39.18 
 
 		 651 aa  52.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  40.43 
 
 		 1887 aa  52.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.01 
 
 		 987 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 458 aa  52.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.29 
 
 		 372 aa  52.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  28.9 
 
 		 449 aa  52.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  38.46 
 
 		 429 aa  51.6  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>