215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0373 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
795 aa  1609    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  67.98 
 
 
552 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  67.54 
 
 
544 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  50 
 
 
569 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  45.12 
 
 
707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.57 
 
 
1212 aa  319  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  48.4 
 
 
1200 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  45.15 
 
 
1213 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.43 
 
 
1109 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  32.91 
 
 
1010 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  31.3 
 
 
473 aa  185  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  32.07 
 
 
423 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.57 
 
 
1448 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  31.58 
 
 
435 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.36 
 
 
933 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  58.99 
 
 
510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.41 
 
 
1001 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.56 
 
 
823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.62 
 
 
208 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.61 
 
 
685 aa  94.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  55.56 
 
 
655 aa  92.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  58.89 
 
 
614 aa  92  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  51.26 
 
 
854 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  56.67 
 
 
762 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  50.91 
 
 
651 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  51.59 
 
 
743 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  53.76 
 
 
617 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  62.92 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  63.41 
 
 
973 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  43.08 
 
 
2170 aa  85.1  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  57.65 
 
 
1121 aa  84.7  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.91 
 
 
729 aa  84  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  50 
 
 
674 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  54.02 
 
 
1137 aa  82.4  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  52.81 
 
 
900 aa  82  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  51.65 
 
 
2334 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  47.2 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  46.74 
 
 
674 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  48.15 
 
 
1154 aa  80.9  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 
674 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.12 
 
 
1209 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  56.19 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.31 
 
 
6885 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  43.01 
 
 
674 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  43.01 
 
 
674 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  43.01 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  43.01 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  43.01 
 
 
674 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  54.46 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  43.01 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.56 
 
 
809 aa  77.8  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  43.81 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  46.53 
 
 
552 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  43.01 
 
 
674 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  48.42 
 
 
1887 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  46.07 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 
658 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  47.52 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  54.32 
 
 
649 aa  74.3  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  46.07 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  48.39 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  44.94 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.89 
 
 
998 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  51.25 
 
 
544 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  43.82 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  46.07 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  44.94 
 
 
455 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  44.94 
 
 
455 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
674 aa  72  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  56.52 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
756 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 
1221 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  44.9 
 
 
456 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  43.01 
 
 
455 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  48.35 
 
 
768 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  42.7 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 
1004 aa  68.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  51.04 
 
 
924 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  42.7 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  50.5 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  52.87 
 
 
1298 aa  67.8  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  42.7 
 
 
749 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  46.73 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  48.94 
 
 
831 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  44.94 
 
 
680 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  41.57 
 
 
787 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  37.82 
 
 
458 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  47.31 
 
 
514 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  58.24 
 
 
429 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  33.64 
 
 
662 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  41.57 
 
 
455 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  36.97 
 
 
458 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.82 
 
 
847 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.26 
 
 
953 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.32 
 
 
929 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  48.76 
 
 
823 aa  64.7  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  44.12 
 
 
548 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  41.57 
 
 
459 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.55 
 
 
703 aa  64.3  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  42.86 
 
 
456 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>