36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3784 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 510 aa  1017    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  60.42 
 
 		 1200 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 795 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0297  endo-alpha-mannosidase  31.5 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.74 
 
 		 933 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.09 
 
 		 1448 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.35 
 
 		 1212 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.47 
 
 		 1109 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  54.41 
 
 		 1213 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.47 
 
 		 1001 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.71 
 
 		 823 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.01 
 
 		 208 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.79 
 
 		 685 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  23.91 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.55 
 
 		 1158 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  23.27 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.47 
 
 		 929 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.21 
 
 		 953 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  30.37 
 
 		 392 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  37.9 
 
 		 1441 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  35.29 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  25.38 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 		 756 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.58 
 
 		 755 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  32.12 
 
 		 1103 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.66 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4327  hypothetical protein  24.26 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.97 
 
 		 1139 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6083  hypothetical protein  20.92 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.753473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  34.69 
 
 		 850 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.48 
 
 		 1028 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  45 
 
 		 1581 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.4 
 
 		 984 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.84 
 
 		 1967 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.24 
 
 		 962 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 1184 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>