136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1236 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  47.92 
 
 		 1887 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.94 
 
 		 6885 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  41.41 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  39.47 
 
 		 1154 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  32.26 
 
 		 667 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  45 
 
 		 544 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  48.48 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  47.25 
 
 		 854 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.12 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  40.65 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  42.86 
 
 		 762 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 458 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.32 
 
 		 743 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.94 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.94 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  40.4 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  41.3 
 
 		 614 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  35.48 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 		 1121 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  34.03 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  38 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  33.87 
 
 		 685 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  33.87 
 
 		 685 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  33.87 
 
 		 685 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 		 809 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  35.48 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  37.5 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  48.19 
 
 		 973 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 		 608 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.71 
 
 		 1137 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.71 
 
 		 1209 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  33.33 
 
 		 655 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  30.86 
 
 		 651 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.81 
 
 		 795 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  34.58 
 
 		 749 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  43.06 
 
 		 2286 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  45 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.3 
 
 		 729 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.14 
 
 		 674 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 459 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.87 
 
 		 2334 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  43.59 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  34.02 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  43.53 
 
 		 1298 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  32.08 
 
 		 787 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  43.18 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  27.36 
 
 		 768 aa  59.3  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  35.48 
 
 		 1221 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  32.08 
 
 		 660 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  35.56 
 
 		 674 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  35.56 
 
 		 674 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  35.56 
 
 		 674 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  35.56 
 
 		 674 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  36.84 
 
 		 680 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4117  Fibronectin type III domain protein  35.11 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.723284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  39.13 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 2170 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.74 
 
 		 703 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  34.44 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  38.14 
 
 		 924 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  38.27 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1004 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  45.05 
 
 		 652 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  34.44 
 
 		 674 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  41.76 
 
 		 1139 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  47.25 
 
 		 662 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  38.2 
 
 		 1160 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  32.32 
 
 		 483 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  31.97 
 
 		 997 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.44 
 
 		 674 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  33.71 
 
 		 847 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  33.33 
 
 		 803 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  34.74 
 
 		 900 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  34.78 
 
 		 831 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  44.33 
 
 		 823 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  32.99 
 
 		 548 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 658 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  30.65 
 
 		 681 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.78 
 
 		 548 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46.43 
 
 		 460 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.56 
 
 		 727 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  34.78 
 
 		 938 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  30.77 
 
 		 483 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 484 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.58 
 
 		 465 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  37.35 
 
 		 1916 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.64 
 
 		 438 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  35.23 
 
 		 699 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.18 
 
 		 598 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  34.12 
 
 		 984 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  33.87 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.23 
 
 		 543 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>