26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6786 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  100 
 
 		 707 aa  1469    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1010 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  43.49 
 
 		 552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.39 
 
 		 795 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  41.84 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  39.66 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  35.52 
 
 		 473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  33.25 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  32.73 
 
 		 423 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  32.24 
 
 		 948 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  34.6 
 
 		 561 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  41.13 
 
 		 1322 aa  88.6  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  34.25 
 
 		 1426 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  32.42 
 
 		 1427 aa  80.9  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  31.32 
 
 		 1422 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  36.44 
 
 		 1124 aa  71.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  28.57 
 
 		 713 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1683  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  28.74 
 
 		 549 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  26.32 
 
 		 568 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  28.4 
 
 		 742 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 1187 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  34.09 
 
 		 617 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  29.89 
 
 		 1160 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.87 
 
 		 3562 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  27.63 
 
 		 1116 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>