63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5033 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  59.78 
 
 
723 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1596  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  50.83 
 
 
778 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1001 aa  1963    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.08 
 
 
1212 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.67 
 
 
1109 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0463  hypothetical protein  29.3 
 
 
818 aa  183  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.177436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.25 
 
 
1448 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.1 
 
 
823 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  51.47 
 
 
510 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  48.18 
 
 
1200 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.55 
 
 
795 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.79 
 
 
933 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  42.34 
 
 
1213 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  47.24 
 
 
1193 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.17 
 
 
208 aa  90.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.37 
 
 
685 aa  89.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  38.76 
 
 
1802 aa  75.1  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  37.21 
 
 
1428 aa  74.7  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.86 
 
 
929 aa  74.7  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  37.21 
 
 
1424 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  38.46 
 
 
1303 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  33.51 
 
 
607 aa  69.7  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  43.48 
 
 
756 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  37.72 
 
 
616 aa  64.7  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  36.52 
 
 
662 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  36.88 
 
 
879 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.59 
 
 
755 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.43 
 
 
1007 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  36.46 
 
 
1736 aa  58.9  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  37.74 
 
 
1879 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  35.44 
 
 
433 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  42.99 
 
 
1035 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  36.89 
 
 
608 aa  54.7  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
756 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  30.34 
 
 
2169 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.62 
 
 
663 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  37.5 
 
 
1073 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.29 
 
 
1158 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.71 
 
 
1028 aa  52  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 
726 aa  51.6  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.2 
 
 
1626 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  30.66 
 
 
671 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  40.48 
 
 
1310 aa  50.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  34.34 
 
 
699 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  24.42 
 
 
1164 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  32.39 
 
 
1581 aa  49.3  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  30.69 
 
 
897 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 
1321 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  34.78 
 
 
332 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
752 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.48 
 
 
1139 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.53 
 
 
815 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  33.61 
 
 
912 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  36.62 
 
 
772 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.43 
 
 
1070 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  35.85 
 
 
1544 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 
674 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  26.23 
 
 
644 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.14 
 
 
1135 aa  45.8  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.67 
 
 
915 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  27.93 
 
 
1029 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  29.61 
 
 
571 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  32.5 
 
 
534 aa  45.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>