186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0285 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  100 
 
 		 1135 aa  2319    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  49.12 
 
 		 927 aa  874    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  97.57 
 
 		 740 aa  1505    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  43.03 
 
 		 880 aa  674    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  50.84 
 
 		 951 aa  917    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  39.41 
 
 		 807 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 807 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  38.07 
 
 		 834 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  36.2 
 
 		 1127 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 592 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 586 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0279  surface layer protein B  97.14 
 
 		 108 aa  204  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.8 
 
 		 454 aa  94.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  36.5 
 
 		 899 aa  90.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  32.13 
 
 		 1164 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  30.13 
 
 		 1070 aa  66.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  45.24 
 
 		 821 aa  63.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  32.26 
 
 		 1439 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.63 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1667 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  44.05 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.25 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.25 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.23 
 
 		 1007 aa  58.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  30.11 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  34.52 
 
 		 1471 aa  58.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.8 
 
 		 1120 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.04 
 
 		 1059 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.35 
 
 		 953 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.47 
 
 		 455 aa  57  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  44.44 
 
 		 838 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  39.74 
 
 		 1686 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  42.11 
 
 		 1172 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.39 
 
 		 3295 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.06 
 
 		 915 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 458 aa  56.2  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.56 
 
 		 1292 aa  56.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.82 
 
 		 1028 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.17 
 
 		 848 aa  56.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.78 
 
 		 815 aa  56.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  32.37 
 
 		 571 aa  56.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  33.33 
 
 		 979 aa  55.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.12 
 
 		 1300 aa  55.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40 
 
 		 1882 aa  55.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  38.75 
 
 		 1173 aa  55.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.94 
 
 		 644 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.5 
 
 		 2272 aa  54.7  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.37 
 
 		 2036 aa  54.7  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  31.15 
 
 		 1103 aa  55.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.15 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  45.12 
 
 		 679 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  45.12 
 
 		 1969 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  32.59 
 
 		 1581 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 578 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.33 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  35.87 
 
 		 788 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.37 
 
 		 735 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  43.42 
 
 		 521 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.33 
 
 		 455 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.47 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.91 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  45.12 
 
 		 561 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.9 
 
 		 1682 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.22 
 
 		 458 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.47 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  31.43 
 
 		 481 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.96 
 
 		 675 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.5 
 
 		 1842 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.67 
 
 		 2122 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.64 
 
 		 2000 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.12 
 
 		 978 aa  52.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 455 aa  52.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.7 
 
 		 962 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.05 
 
 		 528 aa  52.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 752 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.25 
 
 		 1588 aa  52  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.99 
 
 		 801 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.94 
 
 		 356 aa  52  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 		 1158 aa  51.6  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.37 
 
 		 669 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.31 
 
 		 392 aa  51.6  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.17 
 
 		 755 aa  51.6  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.67 
 
 		 576 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  29.91 
 
 		 879 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.46 
 
 		 1109 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37 
 
 		 1356 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.9 
 
 		 184 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.29 
 
 		 615 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.71 
 
 		 2554 aa  51.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.24 
 
 		 1241 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.9 
 
 		 575 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.58 
 
 		 465 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.67 
 
 		 971 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  22.36 
 
 		 1965 aa  51.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  31.71 
 
 		 1001 aa  51.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.1 
 
 		 729 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  28.93 
 
 		 1004 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  34.41 
 
 		 560 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>