28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1487 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  100 
 
 
1172 aa  2380    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  35.42 
 
 
1627 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  28.94 
 
 
953 aa  284  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  26.54 
 
 
1296 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  26.24 
 
 
1001 aa  239  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  36.21 
 
 
431 aa  190  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.47 
 
 
581 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  26.72 
 
 
661 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  28.6 
 
 
561 aa  169  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.93 
 
 
664 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  30.79 
 
 
474 aa  144  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  27.31 
 
 
355 aa  80.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  24.22 
 
 
355 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  29.78 
 
 
1065 aa  60.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  47.78 
 
 
2136 aa  60.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  36.05 
 
 
1937 aa  58.2  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  35.29 
 
 
667 aa  58.2  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  44.3 
 
 
2375 aa  53.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  29.73 
 
 
543 aa  52.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.69 
 
 
2122 aa  51.6  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  46.67 
 
 
2449 aa  49.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  34.29 
 
 
901 aa  48.5  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  58 
 
 
521 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  39.42 
 
 
2272 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.5 
 
 
2179 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  39.24 
 
 
1588 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  33.33 
 
 
1181 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  36 
 
 
1198 aa  45.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>