30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1472 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  100 
 
 
1588 aa  3234    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 
1471 aa  186  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  37.47 
 
 
1001 aa  183  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  32.33 
 
 
1965 aa  159  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  43.8 
 
 
2095 aa  158  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  79.12 
 
 
205 aa  149  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6541  enterotoxin  24.81 
 
 
653 aa  148  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  0.541047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  34.21 
 
 
2095 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  69.89 
 
 
159 aa  135  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  75.9 
 
 
1686 aa  132  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  66.67 
 
 
1173 aa  131  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2394  hypothetical protein  25.88 
 
 
633 aa  116  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.439248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  56.63 
 
 
1127 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0216  hypothetical protein  23.98 
 
 
845 aa  107  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  29 
 
 
1937 aa  97.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.93 
 
 
1264 aa  67.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.97 
 
 
1329 aa  61.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.79 
 
 
1289 aa  57.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.23 
 
 
709 aa  54.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  29.66 
 
 
581 aa  52.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.88 
 
 
688 aa  52.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.25 
 
 
1135 aa  52  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.51 
 
 
704 aa  48.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.78 
 
 
687 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.45 
 
 
805 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  24.68 
 
 
464 aa  46.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  39.24 
 
 
1172 aa  46.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  30.69 
 
 
454 aa  46.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.54 
 
 
1967 aa  45.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  30.23 
 
 
600 aa  45.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>