224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4909 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 915 aa  1864    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.26 
 
 		 815 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 752 aa  202  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.61 
 
 		 1158 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  44 
 
 		 850 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.75 
 
 		 674 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.51 
 
 		 588 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  39.16 
 
 		 4013 aa  181  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.7 
 
 		 1564 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  40.16 
 
 		 987 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.41 
 
 		 962 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  38.64 
 
 		 1581 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.42 
 
 		 581 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  42.19 
 
 		 1059 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  37.55 
 
 		 1441 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.17 
 
 		 578 aa  161  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  55 
 
 		 801 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 		 1362 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  38.03 
 
 		 1028 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 		 578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  51.91 
 
 		 571 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  48 
 
 		 756 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.97 
 
 		 819 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.64 
 
 		 1332 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 1184 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  45.45 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.53 
 
 		 729 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.35 
 
 		 953 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.09 
 
 		 1007 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  44.44 
 
 		 392 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.38 
 
 		 1139 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.9 
 
 		 639 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  43.33 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  55.14 
 
 		 1362 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.28 
 
 		 929 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  48.98 
 
 		 452 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.06 
 
 		 755 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  34.44 
 
 		 2117 aa  101  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  55.06 
 
 		 1103 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  39.05 
 
 		 449 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  44 
 
 		 1070 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.19 
 
 		 940 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  38.92 
 
 		 732 aa  99.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  48.18 
 
 		 1152 aa  99  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  33.6 
 
 		 999 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  40.59 
 
 		 879 aa  97.8  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 1471 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  35.84 
 
 		 558 aa  96.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  53.85 
 
 		 778 aa  94.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  37.36 
 
 		 276 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.62 
 
 		 1321 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  37.89 
 
 		 279 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.89 
 
 		 1117 aa  90.9  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.71 
 
 		 722 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.11 
 
 		 1321 aa  89  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 389 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  57.14 
 
 		 1414 aa  88.2  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  35.8 
 
 		 883 aa  87.8  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  38.05 
 
 		 1338 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  35.4 
 
 		 1028 aa  84.7  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1406 aa  85.1  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.87 
 
 		 984 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.21 
 
 		 1060 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  47.67 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.4 
 
 		 971 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  40.41 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.12 
 
 		 1448 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  38.24 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  37.25 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.67 
 
 		 315 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  36.17 
 
 		 274 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.76 
 
 		 633 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  49.46 
 
 		 1132 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  39.13 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  40.43 
 
 		 1275 aa  79  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.13 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.26 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.48 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  38.93 
 
 		 692 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.14 
 
 		 820 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.79 
 
 		 471 aa  77  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.45 
 
 		 695 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  48.96 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  46.96 
 
 		 1002 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  50 
 
 		 1247 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  41.96 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  43.7 
 
 		 1474 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.53 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.53 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.07 
 
 		 1694 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.75 
 
 		 1585 aa  74.3  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  38.26 
 
 		 470 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.36 
 
 		 703 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  43.36 
 
 		 1217 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  38.82 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.65 
 
 		 984 aa  72.4  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  34.95 
 
 		 330 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.59 
 
 		 979 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>