211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3212 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0600  Penicillin amidase  55.36 
 
 
970 aa  1046    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1853  Penicillin amidase  43.38 
 
 
926 aa  704    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.267516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3441  peptidase S45 penicillin amidase  49.68 
 
 
975 aa  881    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.830206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14090  penicilin amidase  49.84 
 
 
951 aa  953    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
1103 aa  2247    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.2 
 
 
1059 aa  1060    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  50.98 
 
 
1070 aa  1071    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2701  peptidase S45 penicillin amidase  32.91 
 
 
820 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066786  decreased coverage  0.00737149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  50.77 
 
 
1441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.61 
 
 
953 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  51.26 
 
 
392 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.2 
 
 
755 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  57.94 
 
 
999 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.2 
 
 
1007 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.58 
 
 
984 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.85 
 
 
962 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.46 
 
 
756 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.27 
 
 
971 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.85 
 
 
674 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.07 
 
 
637 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  24.3 
 
 
812 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.7 
 
 
1581 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  49.15 
 
 
433 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.97 
 
 
722 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.62 
 
 
695 aa  111  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.97 
 
 
1158 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  40.65 
 
 
850 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.85 
 
 
639 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  46.67 
 
 
987 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.6 
 
 
815 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.41 
 
 
1321 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  49.62 
 
 
571 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  49.25 
 
 
452 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  49.6 
 
 
578 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.54 
 
 
940 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.37 
 
 
801 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  50 
 
 
588 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.06 
 
 
915 aa  101  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.46 
 
 
581 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.43 
 
 
929 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.69 
 
 
478 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 
752 aa  98.2  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.07 
 
 
1117 aa  97.8  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  37.96 
 
 
558 aa  95.9  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  50 
 
 
449 aa  95.5  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.39 
 
 
1362 aa  94.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.61 
 
 
578 aa  94.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.74 
 
 
4013 aa  92.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  23.36 
 
 
804 aa  92  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.83 
 
 
1564 aa  91.3  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.69 
 
 
819 aa  91.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  39.68 
 
 
732 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  45.87 
 
 
1338 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  37.59 
 
 
879 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.82 
 
 
825 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.6 
 
 
729 aa  83.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.19 
 
 
810 aa  81.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.18 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  28.53 
 
 
803 aa  78.2  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.7 
 
 
1139 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  22.76 
 
 
833 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  42.98 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  33.6 
 
 
1061 aa  76.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  40.87 
 
 
487 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.87 
 
 
487 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.27 
 
 
722 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40 
 
 
480 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.73 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.73 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  36.72 
 
 
1028 aa  72.4  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.83 
 
 
472 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.83 
 
 
472 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.67 
 
 
1060 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.78 
 
 
820 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.75 
 
 
1059 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 
1332 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  24.04 
 
 
857 aa  69.3  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.99 
 
 
903 aa  68.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  39.05 
 
 
470 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  22.22 
 
 
822 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  32.12 
 
 
1471 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.52 
 
 
1038 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  24.87 
 
 
906 aa  66.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.14 
 
 
769 aa  65.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  23.67 
 
 
841 aa  65.1  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  21.18 
 
 
808 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  34.21 
 
 
827 aa  62.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  23.43 
 
 
847 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.12 
 
 
112 aa  62  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  22.61 
 
 
812 aa  60.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  21.27 
 
 
818 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  23.64 
 
 
785 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  30.46 
 
 
818 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  22.16 
 
 
819 aa  58.9  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
1184 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.96 
 
 
1055 aa  58.9  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  23.72 
 
 
770 aa  58.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.8 
 
 
792 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
929 aa  58.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  27.81 
 
 
783 aa  58.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>