214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5658 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  52.62 
 
 
818 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
808 aa  1669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  53.75 
 
 
811 aa  922    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  43.88 
 
 
807 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  39.87 
 
 
810 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.15 
 
 
796 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  31.75 
 
 
796 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  32.15 
 
 
796 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.15 
 
 
796 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.63 
 
 
796 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.62 
 
 
796 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.02 
 
 
796 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.48 
 
 
821 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.02 
 
 
796 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.02 
 
 
796 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  31.66 
 
 
796 aa  360  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.14 
 
 
769 aa  351  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.95 
 
 
827 aa  334  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.59 
 
 
779 aa  330  7e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  30.77 
 
 
827 aa  330  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.53 
 
 
829 aa  330  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.46 
 
 
804 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  32.26 
 
 
789 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  30.34 
 
 
855 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.76 
 
 
783 aa  318  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  32.52 
 
 
864 aa  318  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31.08 
 
 
821 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  31.08 
 
 
770 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  30.29 
 
 
810 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  30.42 
 
 
903 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.66 
 
 
843 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  31.49 
 
 
872 aa  311  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  30.88 
 
 
813 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.1 
 
 
870 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.84 
 
 
857 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.82 
 
 
803 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.03 
 
 
787 aa  303  8.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.89 
 
 
854 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.95 
 
 
854 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.37 
 
 
795 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.01 
 
 
817 aa  300  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  30.23 
 
 
858 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29.49 
 
 
780 aa  293  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  28.43 
 
 
823 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.47 
 
 
819 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  28.54 
 
 
848 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.43 
 
 
823 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  29.35 
 
 
906 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.39 
 
 
856 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  30.19 
 
 
818 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.17 
 
 
774 aa  282  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.55 
 
 
809 aa  280  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  27.97 
 
 
874 aa  277  5e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  29.02 
 
 
833 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.97 
 
 
821 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.34 
 
 
809 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 
819 aa  270  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  28 
 
 
885 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.37 
 
 
806 aa  266  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.15 
 
 
847 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.13 
 
 
847 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  27.69 
 
 
822 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.07 
 
 
807 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.23 
 
 
782 aa  258  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  28.1 
 
 
809 aa  257  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  28.1 
 
 
809 aa  257  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.15 
 
 
809 aa  255  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.32 
 
 
827 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  28.97 
 
 
786 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  27.99 
 
 
839 aa  250  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.94 
 
 
829 aa  248  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  27.46 
 
 
821 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.28 
 
 
823 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.69 
 
 
824 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  28.22 
 
 
841 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  29.06 
 
 
889 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.92 
 
 
837 aa  244  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.15 
 
 
795 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 
844 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  25.53 
 
 
837 aa  240  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.52 
 
 
792 aa  240  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  25.06 
 
 
837 aa  240  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.83 
 
 
795 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.39 
 
 
826 aa  240  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  25.06 
 
 
837 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.5 
 
 
803 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  24.94 
 
 
823 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.87 
 
 
824 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  24.94 
 
 
837 aa  237  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  24.94 
 
 
837 aa  237  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  24.94 
 
 
837 aa  237  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  27.27 
 
 
815 aa  237  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  25.9 
 
 
812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  27.8 
 
 
836 aa  235  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  25.67 
 
 
847 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  28.06 
 
 
693 aa  229  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.89 
 
 
816 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  27.71 
 
 
795 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.19 
 
 
787 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  31.33 
 
 
898 aa  220  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>