203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1213 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1108  acylase  65.65 
 
 
813 aa  1103    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  69.58 
 
 
824 aa  1182    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  70.3 
 
 
824 aa  1194    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 
816 aa  1669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  65.53 
 
 
813 aa  1103    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  66 
 
 
847 aa  1174    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  60.94 
 
 
839 aa  1043    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  62.88 
 
 
837 aa  1088    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  65.65 
 
 
813 aa  1102    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  65.41 
 
 
813 aa  1093    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  65.29 
 
 
847 aa  1159    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  39.04 
 
 
848 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  31.04 
 
 
818 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.85 
 
 
829 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  30.26 
 
 
813 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.38 
 
 
804 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  29.75 
 
 
821 aa  313  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  31.72 
 
 
779 aa  309  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.6 
 
 
819 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.37 
 
 
827 aa  305  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.84 
 
 
854 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.73 
 
 
810 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  29.64 
 
 
827 aa  299  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.11 
 
 
819 aa  296  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.1 
 
 
783 aa  295  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.32 
 
 
803 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  28.64 
 
 
843 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.7 
 
 
855 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  28.94 
 
 
821 aa  286  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 
817 aa  280  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.92 
 
 
858 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  30.82 
 
 
789 aa  279  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  29.7 
 
 
770 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.05 
 
 
857 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 
769 aa  273  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.14 
 
 
796 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.89 
 
 
796 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.76 
 
 
796 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.76 
 
 
796 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.29 
 
 
870 aa  267  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  26.25 
 
 
796 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.81 
 
 
796 aa  266  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.23 
 
 
836 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.38 
 
 
796 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.8 
 
 
796 aa  265  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.76 
 
 
796 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 
864 aa  264  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.38 
 
 
796 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.46 
 
 
856 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28.09 
 
 
903 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.26 
 
 
844 aa  260  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  27.99 
 
 
854 aa  260  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.08 
 
 
818 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  28.62 
 
 
872 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.99 
 
 
821 aa  250  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.88 
 
 
795 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.29 
 
 
889 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.76 
 
 
823 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.92 
 
 
792 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.64 
 
 
823 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.11 
 
 
809 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.02 
 
 
787 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.88 
 
 
906 aa  241  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.6 
 
 
809 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  27.64 
 
 
788 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  27.94 
 
 
837 aa  237  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  27.94 
 
 
837 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.25 
 
 
826 aa  236  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.17 
 
 
788 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  29.46 
 
 
795 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  27.82 
 
 
823 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.82 
 
 
837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.82 
 
 
837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.82 
 
 
837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.81 
 
 
827 aa  234  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  27.82 
 
 
837 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.75 
 
 
823 aa  234  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.98 
 
 
787 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.33 
 
 
821 aa  231  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.54 
 
 
787 aa  230  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.96 
 
 
795 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.89 
 
 
808 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.64 
 
 
809 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.77 
 
 
812 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.52 
 
 
795 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.68 
 
 
806 aa  225  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.03 
 
 
811 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.24 
 
 
803 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.85 
 
 
780 aa  223  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.5 
 
 
822 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.96 
 
 
784 aa  221  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  26.4 
 
 
795 aa  220  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.72 
 
 
809 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.72 
 
 
809 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  28.95 
 
 
792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.43 
 
 
818 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.87 
 
 
847 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.79 
 
 
782 aa  210  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.47 
 
 
829 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.74 
 
 
786 aa  204  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>