206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3025 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  100 
 
 
786 aa  1582    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  32.83 
 
 
810 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  36.55 
 
 
804 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  37.58 
 
 
796 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  37.59 
 
 
886 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  37.58 
 
 
796 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  35.48 
 
 
768 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  35.79 
 
 
829 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  38.1 
 
 
797 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  38.39 
 
 
783 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  38.39 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  38.39 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  38.31 
 
 
790 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  38.13 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  38.39 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  38.39 
 
 
815 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  35.68 
 
 
775 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  35.6 
 
 
831 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01150  penicillin acylase II  35.62 
 
 
805 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  32.61 
 
 
769 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  33.04 
 
 
768 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  31.57 
 
 
770 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  32.87 
 
 
782 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  32.81 
 
 
758 aa  364  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  32.3 
 
 
822 aa  363  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  34.98 
 
 
777 aa  356  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  33.01 
 
 
821 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  32.91 
 
 
776 aa  338  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.54 
 
 
796 aa  327  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.54 
 
 
796 aa  327  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.43 
 
 
796 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  29.17 
 
 
796 aa  324  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.3 
 
 
796 aa  324  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 
796 aa  323  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  29.3 
 
 
796 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.3 
 
 
796 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  32.87 
 
 
829 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.63 
 
 
789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.2 
 
 
796 aa  319  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.34 
 
 
796 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  32.04 
 
 
817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  32.19 
 
 
803 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  31.74 
 
 
804 aa  306  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  32.14 
 
 
827 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  33.55 
 
 
770 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  29.35 
 
 
821 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.39 
 
 
783 aa  300  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.99 
 
 
769 aa  300  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  32.59 
 
 
787 aa  300  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.84 
 
 
779 aa  300  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  32.31 
 
 
813 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.84 
 
 
810 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.06 
 
 
827 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  33.46 
 
 
872 aa  290  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  31.76 
 
 
818 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  31.7 
 
 
821 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  29.19 
 
 
818 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  29.15 
 
 
823 aa  279  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.03 
 
 
819 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  29.98 
 
 
833 aa  274  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.74 
 
 
819 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.09 
 
 
843 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  29.9 
 
 
808 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  30.17 
 
 
854 aa  259  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  32.6 
 
 
740 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.56 
 
 
858 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  30.12 
 
 
774 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.16 
 
 
836 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.82 
 
 
855 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  31.77 
 
 
809 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.79 
 
 
854 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  28.95 
 
 
823 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.01 
 
 
903 aa  250  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.02 
 
 
806 aa  249  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.57 
 
 
780 aa  249  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.83 
 
 
823 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.44 
 
 
811 aa  247  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.35 
 
 
870 aa  247  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.55 
 
 
889 aa  245  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.95 
 
 
809 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.34 
 
 
844 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 
857 aa  241  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  29.7 
 
 
847 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  29.27 
 
 
848 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.43 
 
 
807 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  30.57 
 
 
784 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  30.78 
 
 
792 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  30.46 
 
 
782 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.79 
 
 
827 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  29.13 
 
 
906 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.41 
 
 
821 aa  234  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.15 
 
 
826 aa  233  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.81 
 
 
847 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  29.68 
 
 
837 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  29.59 
 
 
837 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29.56 
 
 
823 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.12 
 
 
812 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  29.56 
 
 
837 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29.56 
 
 
837 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  29.56 
 
 
837 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>