194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1174 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  100 
 
 
874 aa  1755    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  32.37 
 
 
885 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  31.69 
 
 
815 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.87 
 
 
811 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 
818 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.7 
 
 
796 aa  287  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.84 
 
 
808 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.63 
 
 
796 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  27.26 
 
 
796 aa  283  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.54 
 
 
796 aa  281  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.19 
 
 
796 aa  281  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.19 
 
 
796 aa  281  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  28.3 
 
 
807 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.97 
 
 
796 aa  277  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.01 
 
 
796 aa  277  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  27.19 
 
 
796 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.06 
 
 
796 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  27.52 
 
 
810 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.52 
 
 
827 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  28.04 
 
 
783 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.89 
 
 
827 aa  259  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2302  peptidase S45 penicillin amidase  27.77 
 
 
831 aa  244  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  27.81 
 
 
770 aa  241  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 
817 aa  240  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  27.28 
 
 
855 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  28.43 
 
 
769 aa  240  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  26.99 
 
 
821 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  26.61 
 
 
803 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.75 
 
 
843 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  26.74 
 
 
804 aa  231  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 
779 aa  228  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.26 
 
 
829 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  26.54 
 
 
854 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  25.77 
 
 
821 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.11 
 
 
787 aa  224  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.27 
 
 
806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.2 
 
 
903 aa  221  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  26.71 
 
 
872 aa  221  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  30.94 
 
 
858 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  26.95 
 
 
789 aa  220  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.96 
 
 
818 aa  220  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  26.21 
 
 
854 aa  218  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  25.97 
 
 
906 aa  218  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  25.15 
 
 
857 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.19 
 
 
780 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  26.34 
 
 
813 aa  205  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.77 
 
 
809 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.77 
 
 
809 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.06 
 
 
810 aa  204  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.35 
 
 
795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.54 
 
 
864 aa  202  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  25.3 
 
 
870 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.71 
 
 
782 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  26.05 
 
 
819 aa  197  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.07 
 
 
795 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  24.94 
 
 
848 aa  193  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  25.26 
 
 
833 aa  193  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 
856 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  27.55 
 
 
822 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.94 
 
 
812 aa  189  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  26.08 
 
 
693 aa  189  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  25.37 
 
 
807 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 
844 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  26.69 
 
 
792 aa  188  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.59 
 
 
823 aa  188  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.07 
 
 
809 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  26.22 
 
 
847 aa  187  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.09 
 
 
788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  24.41 
 
 
837 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  24.13 
 
 
837 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  24.41 
 
 
837 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  24.29 
 
 
823 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  24.29 
 
 
837 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  24.29 
 
 
837 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  24.29 
 
 
837 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  25.44 
 
 
803 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.9 
 
 
809 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  25 
 
 
788 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  25.03 
 
 
824 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  26.57 
 
 
792 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  25.15 
 
 
795 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.64 
 
 
787 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  26.02 
 
 
795 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  25.37 
 
 
824 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  25.71 
 
 
836 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  25.93 
 
 
784 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  25.88 
 
 
819 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  24.67 
 
 
847 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  26.91 
 
 
698 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.03 
 
 
889 aa  172  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  24.76 
 
 
847 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  25.63 
 
 
816 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  26.3 
 
 
809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.53 
 
 
795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  24.84 
 
 
761 aa  164  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  24.78 
 
 
787 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  24.45 
 
 
837 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  24.91 
 
 
841 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  25.12 
 
 
839 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  24.26 
 
 
823 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>