215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2155 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 779 aa  1582    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  72.98 
 
 		 783 aa  1181    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  58.48 
 
 		 770 aa  898    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  45.29 
 
 		 789 aa  615  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  43.61 
 
 		 821 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  45.15 
 
 		 803 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  43.17 
 
 		 804 aa  592  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  43.1 
 
 		 769 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  40.44 
 
 		 821 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  41.36 
 
 		 787 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  39.43 
 
 		 829 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  38.85 
 
 		 810 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  36.16 
 
 		 780 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  37.98 
 
 		 813 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  36.71 
 
 		 819 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  36.23 
 
 		 819 aa  462  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  37.93 
 
 		 818 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  37.15 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  36.31 
 
 		 827 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  34.83 
 
 		 889 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  36 
 
 		 827 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  38.46 
 
 		 836 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  36.34 
 
 		 844 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.46 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.72 
 
 		 796 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  33.84 
 
 		 796 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  33.46 
 
 		 796 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.72 
 
 		 796 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.59 
 
 		 796 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.72 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  32.88 
 
 		 796 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.04 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.33 
 
 		 796 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 823 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  36.52 
 
 		 843 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  34.54 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  35.08 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  34.1 
 
 		 857 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  34.11 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  35.39 
 
 		 855 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  34.12 
 
 		 854 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  36.27 
 
 		 809 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  35.82 
 
 		 809 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  34.6 
 
 		 821 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  34.72 
 
 		 823 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  34.72 
 
 		 823 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  33.07 
 
 		 903 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  33.68 
 
 		 822 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  34.27 
 
 		 837 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  33.98 
 
 		 823 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  34.01 
 
 		 837 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  33.98 
 
 		 837 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  33.98 
 
 		 837 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  37.07 
 
 		 858 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  34.01 
 
 		 837 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  33.98 
 
 		 837 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  34.27 
 
 		 826 aa  365  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  35.57 
 
 		 827 aa  360  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  33.78 
 
 		 829 aa  360  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  32.22 
 
 		 870 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  35.68 
 
 		 906 aa  359  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  33.29 
 
 		 821 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  32.99 
 
 		 812 aa  356  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  32.25 
 
 		 809 aa  356  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  32.25 
 
 		 809 aa  356  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  33 
 
 		 872 aa  346  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  32.47 
 
 		 864 aa  339  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  38.65 
 
 		 641 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  32.16 
 
 		 856 aa  334  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  32.16 
 
 		 807 aa  331  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  31.55 
 
 		 782 aa  331  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  30.93 
 
 		 807 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.59 
 
 		 808 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  32.11 
 
 		 847 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  31.38 
 
 		 818 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.39 
 
 		 811 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  31.63 
 
 		 847 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  31.26 
 
 		 847 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  32.65 
 
 		 784 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  32.1 
 
 		 785 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  31.71 
 
 		 816 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  29.01 
 
 		 810 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  31.57 
 
 		 839 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  32.31 
 
 		 792 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  31.72 
 
 		 824 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  33.07 
 
 		 698 aa  303  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  31.66 
 
 		 818 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  30.8 
 
 		 786 aa  293  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  32.47 
 
 		 792 aa  293  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  30.38 
 
 		 693 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  30.4 
 
 		 824 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  30.32 
 
 		 848 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  30.21 
 
 		 809 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  28.59 
 
 		 841 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  28.07 
 
 		 795 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  30.52 
 
 		 837 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  28.59 
 
 		 761 aa  276  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  30.35 
 
 		 788 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  30.48 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  30.73 
 
 		 762 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>