209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4404 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  51.64 
 
 		 843 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  43.7 
 
 		 870 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  44.48 
 
 		 856 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  55.29 
 
 		 854 aa  927    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  52.45 
 
 		 854 aa  838    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  83.68 
 
 		 906 aa  1451    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  46.92 
 
 		 872 aa  710    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  44.98 
 
 		 864 aa  678    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  52.16 
 
 		 855 aa  849    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  53.59 
 
 		 857 aa  873    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 903 aa  1815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  46.21 
 
 		 858 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  34.62 
 
 		 821 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  35.99 
 
 		 827 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  35.81 
 
 		 827 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  34.87 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  34.88 
 
 		 821 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  35.9 
 
 		 803 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  35.43 
 
 		 829 aa  436  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  36.29 
 
 		 789 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  34.39 
 
 		 817 aa  406  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  35.53 
 
 		 769 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  33.68 
 
 		 783 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  32.39 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  33.68 
 
 		 818 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  32.76 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  33.1 
 
 		 770 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  32.08 
 
 		 819 aa  365  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  31.85 
 
 		 822 aa  363  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  30.12 
 
 		 819 aa  362  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  31.17 
 
 		 889 aa  361  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  33.07 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29.1 
 
 		 780 aa  352  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.81 
 
 		 796 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  31.36 
 
 		 844 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  29.79 
 
 		 806 aa  340  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  32.01 
 
 		 809 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.7 
 
 		 823 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.81 
 
 		 836 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  29.26 
 
 		 818 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  31.02 
 
 		 809 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.94 
 
 		 787 aa  320  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.14 
 
 		 808 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  31.16 
 
 		 774 aa  313  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  31 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.06 
 
 		 796 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.06 
 
 		 796 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  28 
 
 		 848 aa  301  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.25 
 
 		 823 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  31.25 
 
 		 796 aa  300  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 		 811 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.14 
 
 		 823 aa  299  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.9 
 
 		 796 aa  299  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.73 
 
 		 796 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.9 
 
 		 796 aa  298  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.9 
 
 		 796 aa  298  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.73 
 
 		 796 aa  292  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.18 
 
 		 795 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  28 
 
 		 807 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  30.74 
 
 		 827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.1 
 
 		 839 aa  286  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.79 
 
 		 847 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.81 
 
 		 847 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  29.07 
 
 		 833 aa  283  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  29.05 
 
 		 792 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.25 
 
 		 821 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.81 
 
 		 795 aa  277  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.34 
 
 		 809 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.24 
 
 		 812 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.76 
 
 		 795 aa  267  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  28.4 
 
 		 816 aa  264  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.33 
 
 		 824 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 		 847 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.69 
 
 		 837 aa  262  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.65 
 
 		 824 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  28.44 
 
 		 761 aa  252  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.21 
 
 		 782 aa  251  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.01 
 
 		 786 aa  249  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  29.66 
 
 		 837 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.43 
 
 		 829 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  29.66 
 
 		 837 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  29.74 
 
 		 837 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  29.63 
 
 		 837 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29.63 
 
 		 837 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  29.63 
 
 		 837 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29.63 
 
 		 823 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.42 
 
 		 810 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.01 
 
 		 795 aa  244  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 		 787 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  32.47 
 
 		 641 aa  241  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.42 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 		 809 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 		 809 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.69 
 
 		 803 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  57.21 
 
 		 898 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.74 
 
 		 826 aa  233  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.24 
 
 		 807 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  26.91 
 
 		 947 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  26.38 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  27.02 
 
 		 947 aa  227  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>