207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4245 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  45.98 
 
 
809 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  48.2 
 
 
847 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  49.17 
 
 
812 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
784 aa  1522    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  45.98 
 
 
809 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  49.49 
 
 
782 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  78.19 
 
 
792 aa  1139    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  64.38 
 
 
785 aa  903    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  44.24 
 
 
837 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  44.19 
 
 
837 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  44.24 
 
 
837 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  44.11 
 
 
823 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  44.11 
 
 
837 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  44.11 
 
 
837 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  44.11 
 
 
837 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  41.7 
 
 
841 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  36.88 
 
 
807 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  33.41 
 
 
827 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  33.03 
 
 
783 aa  324  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  33.21 
 
 
827 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  32.96 
 
 
789 aa  318  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  32.19 
 
 
817 aa  318  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  32.78 
 
 
779 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.27 
 
 
821 aa  314  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  34.81 
 
 
770 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  32.2 
 
 
821 aa  307  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.72 
 
 
796 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.7 
 
 
796 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.58 
 
 
796 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.95 
 
 
796 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.42 
 
 
796 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.06 
 
 
796 aa  292  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.42 
 
 
796 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  27.45 
 
 
796 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.34 
 
 
796 aa  291  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.45 
 
 
796 aa  290  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  32.03 
 
 
787 aa  289  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.62 
 
 
829 aa  287  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.18 
 
 
804 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  33.88 
 
 
813 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  31.97 
 
 
803 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.59 
 
 
769 aa  283  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  32.16 
 
 
818 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.43 
 
 
810 aa  271  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.64 
 
 
823 aa  267  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  33.08 
 
 
762 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  30.14 
 
 
761 aa  263  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.52 
 
 
836 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.24 
 
 
819 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  31.46 
 
 
809 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.68 
 
 
809 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.73 
 
 
822 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.18 
 
 
819 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29 
 
 
855 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  31.14 
 
 
870 aa  243  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.71 
 
 
839 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  29.93 
 
 
843 aa  237  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.34 
 
 
818 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  29.64 
 
 
889 aa  236  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  30.73 
 
 
786 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.96 
 
 
816 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  30.66 
 
 
774 aa  232  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  31.67 
 
 
856 aa  230  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.78 
 
 
844 aa  227  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  31.34 
 
 
864 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  28.95 
 
 
837 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.29 
 
 
780 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.59 
 
 
858 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.06 
 
 
847 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.7 
 
 
854 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28.31 
 
 
903 aa  222  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.49 
 
 
847 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  31.52 
 
 
821 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  31.22 
 
 
872 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.06 
 
 
810 aa  214  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  29.54 
 
 
813 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.28 
 
 
824 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.26 
 
 
848 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  29.7 
 
 
813 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  29.46 
 
 
813 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.13 
 
 
811 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.55 
 
 
824 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  28.02 
 
 
807 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.71 
 
 
806 aa  204  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  30.16 
 
 
898 aa  203  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.16 
 
 
857 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  28.75 
 
 
813 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  27.59 
 
 
906 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.04 
 
 
808 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  31.09 
 
 
641 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.84 
 
 
821 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  31.74 
 
 
854 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.26 
 
 
823 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.14 
 
 
823 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  22.55 
 
 
795 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  28.03 
 
 
809 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  30.76 
 
 
818 aa  182  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  25.88 
 
 
874 aa  182  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.23 
 
 
795 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.2 
 
 
788 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>