208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1108  acylase  56.7 
 
 
813 aa  934    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  56.82 
 
 
813 aa  936    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  59.83 
 
 
824 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  60.19 
 
 
824 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  60.94 
 
 
816 aa  1043    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  68.33 
 
 
847 aa  1197    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  57.35 
 
 
813 aa  931    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  69.05 
 
 
847 aa  1203    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  100 
 
 
839 aa  1692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  45.83 
 
 
848 aa  717    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  72.25 
 
 
837 aa  1258    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  56.82 
 
 
813 aa  934    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  33.83 
 
 
818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.79 
 
 
829 aa  350  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  33.37 
 
 
813 aa  350  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  32.09 
 
 
821 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  31.24 
 
 
843 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  30.6 
 
 
855 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.3 
 
 
819 aa  319  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.33 
 
 
819 aa  318  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.54 
 
 
821 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  31.5 
 
 
827 aa  317  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.8 
 
 
804 aa  317  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.33 
 
 
817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  30.35 
 
 
854 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  30.69 
 
 
827 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  26.93 
 
 
796 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.93 
 
 
796 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.99 
 
 
796 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.86 
 
 
803 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.28 
 
 
796 aa  300  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.28 
 
 
796 aa  300  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 
779 aa  300  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  32.46 
 
 
864 aa  299  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.33 
 
 
783 aa  299  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.34 
 
 
796 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.89 
 
 
796 aa  297  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.92 
 
 
796 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  31.04 
 
 
870 aa  294  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.69 
 
 
796 aa  294  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.01 
 
 
796 aa  293  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.78 
 
 
836 aa  292  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.99 
 
 
810 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  31.86 
 
 
770 aa  288  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  30.65 
 
 
844 aa  288  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.45 
 
 
769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.23 
 
 
858 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.15 
 
 
857 aa  283  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28.1 
 
 
903 aa  283  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  30.57 
 
 
789 aa  281  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 
856 aa  275  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.64 
 
 
889 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.27 
 
 
854 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  31.16 
 
 
792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  31.11 
 
 
872 aa  266  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
906 aa  264  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.19 
 
 
823 aa  263  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
818 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  28.93 
 
 
809 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.07 
 
 
823 aa  260  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.08 
 
 
809 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.13 
 
 
823 aa  256  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  30.07 
 
 
821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.95 
 
 
809 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  29.83 
 
 
827 aa  255  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  29.02 
 
 
821 aa  255  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.99 
 
 
808 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.78 
 
 
806 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.47 
 
 
803 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 
787 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.12 
 
 
795 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  28.93 
 
 
774 aa  243  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.64 
 
 
795 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.7 
 
 
795 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  26.16 
 
 
795 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  30.66 
 
 
822 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.93 
 
 
780 aa  240  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.91 
 
 
809 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.91 
 
 
809 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
807 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.31 
 
 
788 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.72 
 
 
782 aa  234  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  29.66 
 
 
795 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  28.37 
 
 
826 aa  230  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  29.13 
 
 
784 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  27 
 
 
788 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.17 
 
 
787 aa  227  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.35 
 
 
812 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.62 
 
 
787 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.66 
 
 
829 aa  223  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  27.88 
 
 
837 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  27.88 
 
 
837 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.61 
 
 
786 aa  222  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  27.99 
 
 
837 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.77 
 
 
837 aa  221  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.77 
 
 
837 aa  221  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.77 
 
 
837 aa  221  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.67 
 
 
818 aa  217  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  27.75 
 
 
823 aa  217  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 
811 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>