215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1469 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  75.84 
 
 
804 aa  1272    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  48.66 
 
 
821 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  48.06 
 
 
810 aa  709    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
803 aa  1628    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  43.75 
 
 
821 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  43.56 
 
 
829 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  44.99 
 
 
779 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  44.42 
 
 
783 aa  595  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  44.83 
 
 
770 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  44.82 
 
 
789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  41.9 
 
 
818 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  39.68 
 
 
813 aa  544  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  40.23 
 
 
827 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  38.27 
 
 
819 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  40.65 
 
 
827 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  37.97 
 
 
819 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  40.7 
 
 
769 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  39.93 
 
 
817 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  36.06 
 
 
796 aa  515  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  36.2 
 
 
796 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.7 
 
 
796 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  35.68 
 
 
796 aa  512  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  35.68 
 
 
796 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.7 
 
 
796 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.68 
 
 
796 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.55 
 
 
796 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.77 
 
 
796 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  40.3 
 
 
854 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  36.9 
 
 
823 aa  505  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  35.43 
 
 
796 aa  505  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  39.6 
 
 
843 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  39.09 
 
 
787 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  35.91 
 
 
889 aa  482  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  34.94 
 
 
806 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  35.35 
 
 
780 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  37.84 
 
 
774 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  38.65 
 
 
836 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  36.03 
 
 
844 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  37 
 
 
855 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  37.29 
 
 
821 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  37.44 
 
 
857 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  37.32 
 
 
854 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  35.55 
 
 
903 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  35.16 
 
 
858 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  35.61 
 
 
906 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  36.63 
 
 
809 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  36.63 
 
 
809 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  34.71 
 
 
872 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  34.23 
 
 
823 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  34.23 
 
 
823 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  33.81 
 
 
822 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  35.52 
 
 
827 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  33.71 
 
 
821 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  34.36 
 
 
870 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  33.7 
 
 
864 aa  376  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  38.26 
 
 
641 aa  364  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  32.55 
 
 
807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  31.65 
 
 
826 aa  358  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  31.43 
 
 
818 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  33.33 
 
 
829 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  33.58 
 
 
856 aa  347  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  33.16 
 
 
812 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  33.17 
 
 
837 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  33.17 
 
 
837 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  33.04 
 
 
837 aa  333  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 
809 aa  333  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 
809 aa  333  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  33.04 
 
 
837 aa  333  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  33.04 
 
 
837 aa  333  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  33.04 
 
 
837 aa  333  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  33.04 
 
 
823 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  32.63 
 
 
847 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  30.22 
 
 
848 aa  323  8e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.34 
 
 
808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  32.31 
 
 
782 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  30.47 
 
 
807 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  31.97 
 
 
786 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  30.75 
 
 
837 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  31.01 
 
 
839 aa  313  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  28.7 
 
 
810 aa  312  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  31.99 
 
 
818 aa  310  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.16 
 
 
811 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  30.99 
 
 
809 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  30.4 
 
 
816 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  29.9 
 
 
847 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  30.41 
 
 
824 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  29.63 
 
 
788 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  29.88 
 
 
847 aa  297  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  28.46 
 
 
795 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  31.69 
 
 
792 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  29.37 
 
 
824 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  30.95 
 
 
762 aa  293  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  29.12 
 
 
788 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  30.14 
 
 
795 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  29.2 
 
 
803 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  29.55 
 
 
787 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  32.87 
 
 
724 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  31.67 
 
 
785 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  30.04 
 
 
841 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  29.74 
 
 
795 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>