197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4305 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  58.4 
 
 
889 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  100 
 
 
641 aa  1291    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  62.7 
 
 
844 aa  788    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  62.52 
 
 
836 aa  770    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  48.12 
 
 
813 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  43.3 
 
 
819 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  43.71 
 
 
819 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  45.26 
 
 
821 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  44.41 
 
 
829 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  44.76 
 
 
818 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  37.56 
 
 
809 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  37.21 
 
 
809 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  38.4 
 
 
804 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  38.26 
 
 
803 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  38.98 
 
 
783 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  38.65 
 
 
779 aa  336  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  35.75 
 
 
821 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  38.1 
 
 
774 aa  324  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  36.76 
 
 
787 aa  316  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  36.77 
 
 
789 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  34.94 
 
 
821 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30.88 
 
 
796 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  33.16 
 
 
826 aa  294  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  34.52 
 
 
810 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.66 
 
 
796 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.6 
 
 
796 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  34.22 
 
 
823 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.66 
 
 
796 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.66 
 
 
796 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.6 
 
 
796 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.02 
 
 
796 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  34.68 
 
 
769 aa  290  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.48 
 
 
796 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  34.05 
 
 
823 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.77 
 
 
796 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.37 
 
 
796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  34.7 
 
 
817 aa  283  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  35.52 
 
 
770 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  36.96 
 
 
821 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  33.63 
 
 
829 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  33.88 
 
 
827 aa  267  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  35.26 
 
 
854 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  34.9 
 
 
843 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.93 
 
 
827 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  33.39 
 
 
827 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  34.09 
 
 
854 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  35.06 
 
 
856 aa  257  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  34.74 
 
 
864 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  31.07 
 
 
823 aa  253  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  33.84 
 
 
870 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  31.33 
 
 
806 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  33.88 
 
 
857 aa  246  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29.15 
 
 
780 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  35.09 
 
 
872 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  33.27 
 
 
818 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  31.53 
 
 
855 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  32.47 
 
 
903 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  34.32 
 
 
898 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  30.46 
 
 
822 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  31.65 
 
 
807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  32.72 
 
 
906 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  29.72 
 
 
848 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  31 
 
 
858 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  31.62 
 
 
837 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  32.37 
 
 
785 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  30.53 
 
 
847 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  31.43 
 
 
837 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  31.25 
 
 
823 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  31.25 
 
 
837 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  31.25 
 
 
837 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  31.25 
 
 
837 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  31.25 
 
 
837 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  31.94 
 
 
786 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  31.59 
 
 
847 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  29.9 
 
 
847 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.46 
 
 
818 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  32.17 
 
 
839 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  31.05 
 
 
812 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  28.37 
 
 
795 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 
809 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 
809 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  31.31 
 
 
837 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  33.16 
 
 
792 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.7 
 
 
811 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  30.99 
 
 
782 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  29.1 
 
 
808 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  31.09 
 
 
784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  30.34 
 
 
816 aa  190  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  32.04 
 
 
792 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.83 
 
 
809 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  29.08 
 
 
795 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.74 
 
 
824 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  27.83 
 
 
810 aa  180  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.96 
 
 
795 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  27.22 
 
 
761 aa  178  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  30.91 
 
 
795 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  29.41 
 
 
787 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.72 
 
 
824 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  30.55 
 
 
795 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  32.79 
 
 
807 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>