214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3311 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  50.55 
 
 		 818 aa  851    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  41.1 
 
 		 810 aa  643    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 811 aa  1675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  44.01 
 
 		 807 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  54.04 
 
 		 808 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.16 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.03 
 
 		 796 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.9 
 
 		 796 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  33.16 
 
 		 796 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.9 
 
 		 796 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  32.9 
 
 		 796 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  32.98 
 
 		 796 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.56 
 
 		 796 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.9 
 
 		 796 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.9 
 
 		 796 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  29.37 
 
 		 821 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.2 
 
 		 770 aa  350  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.93 
 
 		 783 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.06 
 
 		 829 aa  336  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  30.12 
 
 		 769 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.31 
 
 		 813 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.23 
 
 		 827 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.57 
 
 		 804 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.91 
 
 		 827 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.05 
 
 		 821 aa  327  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.61 
 
 		 779 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.4 
 
 		 870 aa  323  8e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.08 
 
 		 843 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  29.24 
 
 		 872 aa  319  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  30.05 
 
 		 864 aa  313  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.91 
 
 		 855 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  30.27 
 
 		 789 aa  310  8e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  27.63 
 
 		 817 aa  310  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.05 
 
 		 810 aa  310  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.47 
 
 		 856 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.29 
 
 		 857 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.01 
 
 		 903 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  28.02 
 
 		 874 aa  301  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  27.58 
 
 		 803 aa  301  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  26.19 
 
 		 833 aa  296  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.48 
 
 		 818 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29 
 
 		 780 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  27.92 
 
 		 854 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.47 
 
 		 819 aa  294  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  26.47 
 
 		 885 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.15 
 
 		 806 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.02 
 
 		 819 aa  289  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.63 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.57 
 
 		 848 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.62 
 
 		 906 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.34 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.62 
 
 		 774 aa  278  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  26.76 
 
 		 854 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.09 
 
 		 858 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.53 
 
 		 792 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.61 
 
 		 809 aa  273  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.52 
 
 		 807 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.67 
 
 		 823 aa  268  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.67 
 
 		 823 aa  267  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.39 
 
 		 847 aa  264  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.53 
 
 		 823 aa  263  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.82 
 
 		 809 aa  263  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.81 
 
 		 822 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  25.71 
 
 		 844 aa  260  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  26.52 
 
 		 889 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.27 
 
 		 821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.69 
 
 		 803 aa  255  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  26.86 
 
 		 847 aa  255  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.22 
 
 		 795 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  27.16 
 
 		 815 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  26.13 
 
 		 693 aa  249  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  25.09 
 
 		 837 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  25.09 
 
 		 837 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.44 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.32 
 
 		 795 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  24.97 
 
 		 823 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  24.97 
 
 		 837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  24.97 
 
 		 837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  24.97 
 
 		 837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.32 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.32 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  24.75 
 
 		 837 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  25.97 
 
 		 836 aa  242  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  26.12 
 
 		 824 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.15 
 
 		 837 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  26.21 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.45 
 
 		 788 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.81 
 
 		 788 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.34 
 
 		 824 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.71 
 
 		 787 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  27.76 
 
 		 795 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  26.17 
 
 		 698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  25.48 
 
 		 827 aa  233  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  25.59 
 
 		 829 aa  233  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  26.9 
 
 		 787 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26 
 
 		 826 aa  233  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  24.81 
 
 		 782 aa  233  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  26.2 
 
 		 841 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  27.3 
 
 		 774 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>