197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2845 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  100 
 
 
823 aa  1670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  59.88 
 
 
826 aa  1001    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  63.77 
 
 
829 aa  1079    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  68.24 
 
 
827 aa  1122    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  55.53 
 
 
818 aa  848    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  99.51 
 
 
823 aa  1662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  90.34 
 
 
821 aa  1501    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  35.57 
 
 
829 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  34.97 
 
 
821 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  34.6 
 
 
813 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  33.01 
 
 
819 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  32.6 
 
 
819 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  34.71 
 
 
774 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  33.25 
 
 
818 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  35.34 
 
 
821 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  33.17 
 
 
804 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  34.55 
 
 
803 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  34.62 
 
 
783 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  34.51 
 
 
779 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  31.95 
 
 
844 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.59 
 
 
821 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  31.33 
 
 
889 aa  362  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.38 
 
 
789 aa  360  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.87 
 
 
796 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.85 
 
 
796 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.85 
 
 
796 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.12 
 
 
796 aa  354  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.97 
 
 
796 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.1 
 
 
796 aa  353  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.07 
 
 
796 aa  353  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  33.21 
 
 
810 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.97 
 
 
796 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.85 
 
 
796 aa  351  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.96 
 
 
836 aa  348  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.48 
 
 
796 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  34.06 
 
 
770 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29.04 
 
 
780 aa  337  7e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.52 
 
 
769 aa  330  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  32.06 
 
 
809 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  31.25 
 
 
827 aa  323  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  31.51 
 
 
809 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  30.86 
 
 
827 aa  317  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  30.3 
 
 
806 aa  316  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.06 
 
 
854 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.64 
 
 
843 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  30.42 
 
 
817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.02 
 
 
787 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.95 
 
 
855 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.14 
 
 
903 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  34.05 
 
 
641 aa  289  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  28.43 
 
 
808 aa  287  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  28.63 
 
 
906 aa  287  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.49 
 
 
854 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 
823 aa  282  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.82 
 
 
857 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.67 
 
 
818 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  30.02 
 
 
864 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  29.58 
 
 
837 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  30.73 
 
 
837 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  27.69 
 
 
847 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  30.25 
 
 
823 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  30.25 
 
 
837 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  30.25 
 
 
837 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  30.25 
 
 
837 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.71 
 
 
761 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  30.25 
 
 
837 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  30.25 
 
 
837 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.74 
 
 
870 aa  262  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.93 
 
 
858 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.07 
 
 
839 aa  260  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.61 
 
 
811 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  25.76 
 
 
795 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.71 
 
 
824 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.36 
 
 
847 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.36 
 
 
795 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.43 
 
 
809 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  26.39 
 
 
848 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  28.18 
 
 
824 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.08 
 
 
807 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.61 
 
 
803 aa  245  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.47 
 
 
795 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.64 
 
 
816 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.06 
 
 
822 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  28.22 
 
 
788 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  28.83 
 
 
786 aa  237  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  28.2 
 
 
872 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.37 
 
 
856 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.66 
 
 
782 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.02 
 
 
809 aa  230  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.02 
 
 
809 aa  230  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  27.53 
 
 
788 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.59 
 
 
792 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.89 
 
 
787 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.28 
 
 
812 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.18 
 
 
787 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.4 
 
 
810 aa  220  7e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.32 
 
 
795 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  26.89 
 
 
813 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  26.23 
 
 
813 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  26.71 
 
 
813 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>