214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4858 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  65.87 
 
 
788 aa  1074    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  94.84 
 
 
795 aa  1536    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  100 
 
 
795 aa  1628    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  65.7 
 
 
787 aa  1077    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  70.3 
 
 
803 aa  1174    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  61.17 
 
 
809 aa  1028    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  67.84 
 
 
795 aa  1127    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  68.98 
 
 
795 aa  1144    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  65.53 
 
 
788 aa  1090    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  64.94 
 
 
792 aa  1090    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  65.62 
 
 
787 aa  1075    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  37.5 
 
 
795 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.99 
 
 
817 aa  320  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31.94 
 
 
821 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  30.21 
 
 
827 aa  311  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.59 
 
 
829 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  29.94 
 
 
843 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  29.4 
 
 
827 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.46 
 
 
796 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.73 
 
 
796 aa  303  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.34 
 
 
796 aa  301  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.61 
 
 
796 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  29.57 
 
 
821 aa  301  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.4 
 
 
796 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.4 
 
 
796 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  29.78 
 
 
804 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.27 
 
 
796 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.15 
 
 
796 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.68 
 
 
769 aa  295  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.85 
 
 
810 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  32.19 
 
 
789 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.4 
 
 
796 aa  289  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.43 
 
 
803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.7 
 
 
796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  30.58 
 
 
854 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.59 
 
 
836 aa  271  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  27.91 
 
 
855 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.47 
 
 
819 aa  270  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.82 
 
 
813 aa  270  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.45 
 
 
844 aa  269  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.61 
 
 
818 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.89 
 
 
819 aa  265  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 
818 aa  263  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  29.56 
 
 
787 aa  263  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.05 
 
 
779 aa  262  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.9 
 
 
783 aa  260  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  29.58 
 
 
807 aa  257  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.69 
 
 
870 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.1 
 
 
811 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.93 
 
 
848 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.91 
 
 
837 aa  254  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  29.5 
 
 
770 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  30.24 
 
 
774 aa  253  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  27.39 
 
 
847 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.34 
 
 
847 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.38 
 
 
812 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.85 
 
 
808 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.02 
 
 
829 aa  243  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.15 
 
 
903 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.12 
 
 
839 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.27 
 
 
823 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  28.94 
 
 
872 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.1 
 
 
889 aa  239  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.38 
 
 
824 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 
857 aa  234  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.91 
 
 
822 aa  234  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.99 
 
 
809 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.16 
 
 
854 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.19 
 
 
858 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.01 
 
 
816 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.71 
 
 
826 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.72 
 
 
809 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.54 
 
 
780 aa  230  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
809 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
809 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 
806 aa  225  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.62 
 
 
824 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.2 
 
 
856 aa  224  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.28 
 
 
827 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.74 
 
 
823 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.62 
 
 
823 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.42 
 
 
807 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  28.18 
 
 
782 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  27.05 
 
 
833 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.61 
 
 
821 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  26.97 
 
 
864 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.31 
 
 
821 aa  204  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  25.82 
 
 
885 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.59 
 
 
786 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  27.33 
 
 
785 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  26.07 
 
 
874 aa  194  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  26.5 
 
 
813 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  27.41 
 
 
797 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  29.18 
 
 
837 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  29.18 
 
 
837 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  27.58 
 
 
886 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  30.2 
 
 
847 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  29.18 
 
 
837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29 
 
 
823 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29 
 
 
837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>