211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3478 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 847 aa  1714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  47.9 
 
 		 784 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  42.79 
 
 		 841 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  65.25 
 
 		 812 aa  1065    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  51.34 
 
 		 782 aa  791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  49.38 
 
 		 792 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  53.03 
 
 		 809 aa  823    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  53.03 
 
 		 809 aa  823    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  47.89 
 
 		 785 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  41.67 
 
 		 837 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  41.67 
 
 		 837 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  41.64 
 
 		 837 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  41.55 
 
 		 837 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  41.55 
 
 		 837 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  41.55 
 
 		 837 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  41.9 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  38.21 
 
 		 807 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  32.21 
 
 		 817 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  32.57 
 
 		 827 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.82 
 
 		 827 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  30.36 
 
 		 821 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.16 
 
 		 789 aa  335  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  31.16 
 
 		 810 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  32.63 
 
 		 803 aa  330  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  32.35 
 
 		 779 aa  328  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  32.24 
 
 		 804 aa  327  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.42 
 
 		 783 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.59 
 
 		 796 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.49 
 
 		 796 aa  317  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.84 
 
 		 796 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.12 
 
 		 796 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.12 
 
 		 796 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  32.45 
 
 		 770 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.16 
 
 		 796 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.12 
 
 		 796 aa  313  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28 
 
 		 796 aa  312  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.37 
 
 		 796 aa  311  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  32.09 
 
 		 858 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.86 
 
 		 796 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.72 
 
 		 829 aa  300  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  31.81 
 
 		 854 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.34 
 
 		 787 aa  298  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31 
 
 		 821 aa  294  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.95 
 
 		 823 aa  294  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  27.57 
 
 		 780 aa  288  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  30.67 
 
 		 769 aa  288  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  30.75 
 
 		 855 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.83 
 
 		 870 aa  286  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.94 
 
 		 822 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  31.52 
 
 		 813 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  31.59 
 
 		 843 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.61 
 
 		 819 aa  274  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.05 
 
 		 809 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  30.29 
 
 		 857 aa  269  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  29.12 
 
 		 761 aa  266  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 		 864 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  28.25 
 
 		 819 aa  264  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.55 
 
 		 854 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.29 
 
 		 903 aa  263  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.69 
 
 		 809 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.54 
 
 		 818 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.58 
 
 		 856 aa  259  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  30.46 
 
 		 889 aa  257  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.72 
 
 		 872 aa  257  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.89 
 
 		 818 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  30.3 
 
 		 762 aa  253  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  29.58 
 
 		 806 aa  253  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  29.28 
 
 		 847 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.07 
 
 		 844 aa  246  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.47 
 
 		 847 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  31.06 
 
 		 795 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.55 
 
 		 795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  29.05 
 
 		 836 aa  240  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  30.48 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  25.67 
 
 		 808 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  28.21 
 
 		 774 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  28.4 
 
 		 906 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.49 
 
 		 839 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.72 
 
 		 811 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  28.45 
 
 		 816 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  28.51 
 
 		 837 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  26.54 
 
 		 848 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.73 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  28 
 
 		 809 aa  224  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  27.48 
 
 		 788 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.56 
 
 		 803 aa  221  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.82 
 
 		 807 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  31.86 
 
 		 898 aa  219  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.02 
 
 		 786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.91 
 
 		 795 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  28.47 
 
 		 813 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  31.59 
 
 		 641 aa  213  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  28.41 
 
 		 787 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  27.96 
 
 		 813 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.75 
 
 		 788 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.75 
 
 		 821 aa  212  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  27.98 
 
 		 813 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.57 
 
 		 810 aa  209  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  27.98 
 
 		 787 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.75 
 
 		 821 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>