198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1108 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1108  acylase  100 
 
 		 813 aa  1632    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  90.04 
 
 		 813 aa  1476    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  63.08 
 
 		 824 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  62.95 
 
 		 824 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  65.65 
 
 		 816 aa  1103    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  56.7 
 
 		 839 aa  934    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  97.29 
 
 		 813 aa  1592    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  61.16 
 
 		 847 aa  1040    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  59.52 
 
 		 837 aa  996    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  99.02 
 
 		 813 aa  1620    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  60.92 
 
 		 847 aa  1031    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  37.5 
 
 		 848 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  31.09 
 
 		 818 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  30.49 
 
 		 813 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.96 
 
 		 810 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  28.94 
 
 		 829 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  29.27 
 
 		 827 aa  267  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  29.26 
 
 		 821 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  29.38 
 
 		 827 aa  265  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.61 
 
 		 803 aa  257  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.81 
 
 		 819 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.55 
 
 		 870 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.53 
 
 		 819 aa  253  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.54 
 
 		 817 aa  251  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.83 
 
 		 804 aa  249  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  27.24 
 
 		 855 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.74 
 
 		 864 aa  244  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.1 
 
 		 821 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.38 
 
 		 779 aa  241  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  27.5 
 
 		 854 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.46 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 769 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  29.64 
 
 		 789 aa  237  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  29.23 
 
 		 770 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  27.84 
 
 		 843 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.36 
 
 		 856 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  25.03 
 
 		 796 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.6 
 
 		 796 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.6 
 
 		 796 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.27 
 
 		 796 aa  233  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.12 
 
 		 796 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.29 
 
 		 796 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.16 
 
 		 796 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 		 796 aa  230  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.81 
 
 		 827 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.09 
 
 		 796 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.97 
 
 		 796 aa  228  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.27 
 
 		 858 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.21 
 
 		 844 aa  224  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.4 
 
 		 818 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.99 
 
 		 857 aa  220  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.73 
 
 		 812 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.84 
 
 		 823 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.1 
 
 		 809 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  29.83 
 
 		 872 aa  213  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.71 
 
 		 823 aa  212  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.73 
 
 		 823 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.59 
 
 		 826 aa  209  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.85 
 
 		 821 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.72 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.23 
 
 		 818 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  27.64 
 
 		 836 aa  205  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.76 
 
 		 809 aa  203  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  26.33 
 
 		 822 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  30.38 
 
 		 792 aa  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.34 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.41 
 
 		 808 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  29.33 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.13 
 
 		 811 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.11 
 
 		 889 aa  198  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.48 
 
 		 787 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.21 
 
 		 903 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  27.39 
 
 		 762 aa  194  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.19 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.57 
 
 		 821 aa  193  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.28 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.28 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  24.8 
 
 		 906 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  26.6 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.49 
 
 		 847 aa  188  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.58 
 
 		 792 aa  187  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.34 
 
 		 788 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.71 
 
 		 829 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.81 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.81 
 
 		 837 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  29 
 
 		 785 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.22 
 
 		 780 aa  184  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.82 
 
 		 837 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  26.69 
 
 		 837 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  26.69 
 
 		 837 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  26.69 
 
 		 837 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.8 
 
 		 788 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.07 
 
 		 795 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  27.62 
 
 		 795 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  24.38 
 
 		 774 aa  181  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  26.83 
 
 		 823 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.5 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.27 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.74 
 
 		 786 aa  177  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  24.45 
 
 		 807 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>