198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1137 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1108  acylase  90.04 
 
 		 813 aa  1476    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  63.08 
 
 		 824 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  62.83 
 
 		 824 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  65.41 
 
 		 816 aa  1093    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  100 
 
 		 813 aa  1634    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  91.02 
 
 		 813 aa  1487    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  59.34 
 
 		 847 aa  1013    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  57.35 
 
 		 839 aa  931    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  59.06 
 
 		 837 aa  981    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  89.54 
 
 		 813 aa  1470    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  59.62 
 
 		 847 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  37.42 
 
 		 848 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.97 
 
 		 810 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  30.16 
 
 		 813 aa  270  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  28.5 
 
 		 829 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.64 
 
 		 870 aa  267  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.37 
 
 		 818 aa  265  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  29.43 
 
 		 827 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.05 
 
 		 803 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.8 
 
 		 821 aa  259  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  27.52 
 
 		 855 aa  257  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.94 
 
 		 827 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.13 
 
 		 817 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.26 
 
 		 804 aa  254  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  28.26 
 
 		 821 aa  253  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  29.33 
 
 		 864 aa  251  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 		 856 aa  246  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.08 
 
 		 854 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.62 
 
 		 819 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  28.27 
 
 		 783 aa  241  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.85 
 
 		 819 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  28.95 
 
 		 769 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  28.7 
 
 		 770 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  29 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  28.57 
 
 		 789 aa  234  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.76 
 
 		 843 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.99 
 
 		 796 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.35 
 
 		 844 aa  228  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.38 
 
 		 796 aa  227  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.38 
 
 		 796 aa  227  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.29 
 
 		 796 aa  227  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  25.06 
 
 		 796 aa  227  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.51 
 
 		 858 aa  227  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.06 
 
 		 796 aa  227  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.06 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.83 
 
 		 818 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  25.19 
 
 		 796 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.97 
 
 		 796 aa  223  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.01 
 
 		 872 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.96 
 
 		 827 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.38 
 
 		 857 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.47 
 
 		 796 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.26 
 
 		 809 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.96 
 
 		 809 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.23 
 
 		 836 aa  219  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.18 
 
 		 823 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.23 
 
 		 823 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.41 
 
 		 818 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.23 
 
 		 823 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.65 
 
 		 826 aa  212  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.67 
 
 		 903 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.95 
 
 		 821 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.01 
 
 		 809 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.12 
 
 		 812 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.66 
 
 		 822 aa  204  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.15 
 
 		 808 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.01 
 
 		 906 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  26.18 
 
 		 854 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.97 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.56 
 
 		 806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.03 
 
 		 788 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  26.92 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.78 
 
 		 787 aa  197  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.06 
 
 		 788 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  28.5 
 
 		 784 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.62 
 
 		 811 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  29.02 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.53 
 
 		 795 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  27.28 
 
 		 795 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  27.07 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  26.53 
 
 		 803 aa  188  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  26.47 
 
 		 847 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  28.37 
 
 		 792 aa  187  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.63 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.63 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.97 
 
 		 821 aa  187  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.66 
 
 		 837 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.66 
 
 		 837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.66 
 
 		 837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.92 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.84 
 
 		 761 aa  185  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  26.54 
 
 		 837 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  26.54 
 
 		 837 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  26.54 
 
 		 837 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  26.51 
 
 		 823 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.19 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.57 
 
 		 795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.16 
 
 		 829 aa  181  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.72 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  24.44 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>