215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3975 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  52.62 
 
 		 808 aa  872    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 818 aa  1679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  50.18 
 
 		 811 aa  841    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  43.3 
 
 		 807 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  40.1 
 
 		 810 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.33 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  33.81 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.2 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  33.9 
 
 		 796 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  33.94 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.2 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.25 
 
 		 796 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.81 
 
 		 796 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.81 
 
 		 796 aa  386  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.55 
 
 		 796 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  33.08 
 
 		 821 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.89 
 
 		 804 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  32.43 
 
 		 810 aa  354  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.27 
 
 		 769 aa  354  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  32.59 
 
 		 827 aa  353  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  32.26 
 
 		 827 aa  347  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  32.55 
 
 		 770 aa  347  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  31.3 
 
 		 803 aa  344  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  31.33 
 
 		 872 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  30.47 
 
 		 855 aa  339  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  30.97 
 
 		 870 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  32.56 
 
 		 783 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  31.24 
 
 		 843 aa  333  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  30.67 
 
 		 864 aa  333  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.88 
 
 		 857 aa  331  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  31.45 
 
 		 813 aa  331  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.82 
 
 		 817 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.89 
 
 		 829 aa  328  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.71 
 
 		 789 aa  326  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.26 
 
 		 903 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31.06 
 
 		 821 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  31.38 
 
 		 779 aa  323  8e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  31.34 
 
 		 854 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  30.74 
 
 		 780 aa  322  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.43 
 
 		 854 aa  317  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  28.14 
 
 		 906 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 		 806 aa  312  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 		 787 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  29.33 
 
 		 848 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.89 
 
 		 858 aa  305  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  30.61 
 
 		 822 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  29.07 
 
 		 823 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.4 
 
 		 847 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.34 
 
 		 856 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.33 
 
 		 774 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  30.72 
 
 		 819 aa  291  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  29.91 
 
 		 885 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.37 
 
 		 847 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.73 
 
 		 819 aa  287  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  28.04 
 
 		 874 aa  287  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  28.63 
 
 		 833 aa  287  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  28.06 
 
 		 795 aa  286  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 		 844 aa  285  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.75 
 
 		 818 aa  283  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.32 
 
 		 807 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.16 
 
 		 809 aa  275  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  29.72 
 
 		 836 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.07 
 
 		 786 aa  273  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.65 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  28.55 
 
 		 782 aa  272  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.67 
 
 		 823 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.67 
 
 		 823 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  29 
 
 		 889 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.74 
 
 		 837 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.68 
 
 		 795 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.6 
 
 		 809 aa  265  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.57 
 
 		 821 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  27.78 
 
 		 841 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.32 
 
 		 837 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.53 
 
 		 837 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.53 
 
 		 837 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.2 
 
 		 795 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  26.41 
 
 		 823 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.62 
 
 		 839 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  26.41 
 
 		 837 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  26.41 
 
 		 837 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  26.41 
 
 		 837 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  29.22 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.67 
 
 		 809 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  28.29 
 
 		 809 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  28.29 
 
 		 809 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.48 
 
 		 803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.08 
 
 		 816 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.72 
 
 		 824 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.59 
 
 		 824 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.15 
 
 		 847 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.28 
 
 		 812 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  28.81 
 
 		 792 aa  244  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.59 
 
 		 795 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  27.18 
 
 		 788 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  27.94 
 
 		 774 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  27.18 
 
 		 788 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.98 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  27.57 
 
 		 821 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.12 
 
 		 787 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>