213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4248 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  51.25 
 
 
855 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  62.04 
 
 
854 aa  1029    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
857 aa  1722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  53.58 
 
 
906 aa  845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  47.96 
 
 
872 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  47.11 
 
 
864 aa  706    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  45.31 
 
 
870 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  52.3 
 
 
854 aa  807    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  45.43 
 
 
858 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  53.43 
 
 
843 aa  854    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  45.91 
 
 
856 aa  668    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  53.64 
 
 
903 aa  893    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  50.43 
 
 
898 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  35.04 
 
 
821 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  37.19 
 
 
829 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  37.5 
 
 
803 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  35.32 
 
 
827 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  35.26 
 
 
827 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  36.2 
 
 
789 aa  441  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  34.98 
 
 
804 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  34.37 
 
 
783 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.92 
 
 
796 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.92 
 
 
796 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  31.8 
 
 
796 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  31.45 
 
 
796 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.37 
 
 
796 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  35.64 
 
 
821 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.25 
 
 
796 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.8 
 
 
796 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  31.8 
 
 
796 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.33 
 
 
796 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.41 
 
 
796 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  34.75 
 
 
810 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  34.34 
 
 
779 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  34.86 
 
 
817 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  34.76 
 
 
769 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  36.86 
 
 
770 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  35.36 
 
 
818 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  33.58 
 
 
787 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  32.72 
 
 
889 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  32.34 
 
 
822 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  34.95 
 
 
813 aa  379  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  31.36 
 
 
819 aa  376  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  33.06 
 
 
844 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  30.43 
 
 
823 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  31.34 
 
 
819 aa  372  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  31.4 
 
 
806 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  30.28 
 
 
780 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  33.37 
 
 
809 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  32.98 
 
 
774 aa  350  7e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  33.21 
 
 
809 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  33.53 
 
 
836 aa  347  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  29.63 
 
 
818 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  28.81 
 
 
848 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.92 
 
 
847 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  29.83 
 
 
808 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.59 
 
 
847 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  26.9 
 
 
811 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  31.65 
 
 
821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  30.67 
 
 
827 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.73 
 
 
807 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.35 
 
 
823 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.35 
 
 
823 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 
833 aa  292  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.31 
 
 
839 aa  291  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  26.54 
 
 
810 aa  290  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.83 
 
 
824 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  31.77 
 
 
837 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.96 
 
 
824 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  31.53 
 
 
837 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.48 
 
 
809 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.34 
 
 
816 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  31.53 
 
 
837 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  31.41 
 
 
823 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  31.41 
 
 
837 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  31.41 
 
 
837 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  31.41 
 
 
837 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.25 
 
 
795 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.84 
 
 
807 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  29.4 
 
 
761 aa  280  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.99 
 
 
837 aa  277  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.56 
 
 
829 aa  272  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.5 
 
 
812 aa  271  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  30.3 
 
 
795 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  28.55 
 
 
782 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.05 
 
 
821 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  30.12 
 
 
795 aa  268  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  30.54 
 
 
847 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  30.15 
 
 
792 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  29.25 
 
 
809 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  29.25 
 
 
809 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  33.88 
 
 
641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  29.03 
 
 
788 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  28.62 
 
 
788 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  26.98 
 
 
795 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.88 
 
 
826 aa  243  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28 
 
 
787 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.71 
 
 
795 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.75 
 
 
803 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  28.47 
 
 
786 aa  238  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>