211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4884 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  53.11 
 
 
854 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
906 aa  1818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  55.09 
 
 
854 aa  906    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  46.15 
 
 
856 aa  675    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  43.71 
 
 
870 aa  668    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  53.45 
 
 
855 aa  853    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  45.94 
 
 
864 aa  688    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  47.44 
 
 
872 aa  713    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  53.18 
 
 
857 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  46.33 
 
 
858 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  83.68 
 
 
903 aa  1524    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  51.48 
 
 
843 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  33.52 
 
 
821 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  35.96 
 
 
827 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  36.03 
 
 
827 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  35.73 
 
 
803 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  34.64 
 
 
804 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  33.78 
 
 
829 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  34.98 
 
 
821 aa  426  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  35.62 
 
 
789 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  34.03 
 
 
783 aa  403  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  33.11 
 
 
817 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  35.15 
 
 
769 aa  392  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  32.67 
 
 
779 aa  379  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  32.88 
 
 
818 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 
810 aa  376  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  33.03 
 
 
770 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  31.21 
 
 
822 aa  363  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.83 
 
 
819 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  33.18 
 
 
813 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  30.13 
 
 
819 aa  355  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  31.42 
 
 
889 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  29.19 
 
 
780 aa  352  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  31.39 
 
 
806 aa  347  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  31.21 
 
 
844 aa  347  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  32.73 
 
 
836 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  32.09 
 
 
787 aa  335  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.21 
 
 
823 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  31.85 
 
 
809 aa  327  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.84 
 
 
818 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  31.85 
 
 
809 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  31.61 
 
 
774 aa  320  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.54 
 
 
823 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.43 
 
 
823 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  28.3 
 
 
848 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.72 
 
 
796 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30.22 
 
 
796 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.96 
 
 
796 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.96 
 
 
796 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  30.74 
 
 
833 aa  301  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.61 
 
 
796 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.96 
 
 
796 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.78 
 
 
796 aa  300  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.78 
 
 
796 aa  300  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.61 
 
 
796 aa  299  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  29.71 
 
 
808 aa  297  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  30.8 
 
 
827 aa  296  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.43 
 
 
796 aa  293  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  28.71 
 
 
847 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  26.65 
 
 
811 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.71 
 
 
847 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.68 
 
 
807 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.14 
 
 
821 aa  286  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  26.81 
 
 
795 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.1 
 
 
839 aa  283  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  28.13 
 
 
809 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.09 
 
 
824 aa  268  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.48 
 
 
837 aa  260  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.19 
 
 
824 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.34 
 
 
795 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.6 
 
 
816 aa  258  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.25 
 
 
795 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  28.77 
 
 
826 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.57 
 
 
788 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.06 
 
 
812 aa  254  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.08 
 
 
829 aa  254  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  29.1 
 
 
847 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  26.62 
 
 
795 aa  251  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.09 
 
 
795 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.63 
 
 
782 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  28.34 
 
 
788 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.74 
 
 
786 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.16 
 
 
787 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  33.06 
 
 
641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.5 
 
 
807 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  59.02 
 
 
898 aa  243  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.91 
 
 
787 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  28.31 
 
 
837 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  28.12 
 
 
837 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  28.12 
 
 
837 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.66 
 
 
803 aa  232  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  28.02 
 
 
837 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  28.02 
 
 
837 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  28.02 
 
 
837 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  28.18 
 
 
823 aa  231  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.8 
 
 
809 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.8 
 
 
809 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  25.82 
 
 
874 aa  228  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  23.51 
 
 
810 aa  226  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  28.03 
 
 
947 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>